【摘要】：一串红为唇型科鼠尾草属多年生草本花卉,原产于南美洲热带地区,常作1、2年生栽培。其花序修长,总状花序开花不断,花期较长,观赏价值高,广泛用作花丛、花坛、组合盆栽,也用于花境与林缘小道的镶边。通过几十年的育种积累,我们拥有了300多份一串红品系资源。为了能够深入挖掘一串红优良性状的遗传特性,我们选取野生型‘35'与其突变型‘彩铃虹'为材料,各混合同一生长阶段的10株的根、茎和叶片,提取RNA,利用Illumina Cluster Station和Illumina Genome Analyzer系统进行转录组测序,通过比对、拼接和组装,获得含49 310个基因片段的一串红转录组序列库。对其进行进一步分析,开发出2 453个SSR序列和1 966个2个品系间的SNP序列。将所得49 310个基因序列与各类基因功能数据库进行比对,分别对24 888个基因进行了GO功能富集注释,对6 995个基因进行了Ke99代谢通路富集注释,对9 896个基因进行了COG功能富集分析,同时,获得了33 925个Nr、23 167个Nt、25 371个swissprot和34 081个trembl基因功能注释。通过IDEG6 software检测,筛选到143个2品系间的差异表达基因。