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《第二届全国生物入侵学术研讨会论文摘要集》2008年
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SSR和SRAP标记揭示大豆疫霉菌遗传多样性的差异分析

范勇  陈庆河  赵健  兰成忠  李本金  翁启勇  
【摘要】:利用抗病品种对病害进行有效的防治需要准确地掌握其病原菌群体遗传结构特征。因此,了解和把握病原菌群体结构特征及其变化规律,对掌握病原菌在各地区的组成和分布以及变化动态,明确其群体遗传结构变化与病害流行的关系,合理布局抗病品种,控制病害的流行都有着重要意义。序列相关扩增多态性(seqenence-related amplified polymorphism,SRAP)标记是近年来发展的基于PCR的新型分子标记。其目标是检测基因组中的可阅读框(ORE)的多态性,是一种无需任何序列信息即可直接PCR扩增的新型分子标记技术。而简单序列重复(simplesequence repeats,SSRs)是以1-6个碱基为基元的串联重复序列,重复数具有高频率的变异,具有多态性高、多等位性、共显性、重复性高等特点。本研究分别用SSR(simp le sequence repeat)和SRAP(sequence-related amplified polymorphism)标记分析了来自我国的128个大豆疫霉(Phytophthora sojae)的遗传距离,并进行聚类分析,构建聚类图。从110对SRAP引物组合中筛选出11对多态性较好的组合扩增得到了195条扩增带,其中有96条多态性带,多态性带的比率平均为49.2%;10对SSR引物共扩增出55条谱带,单个引物所扩增的条带数范围在2-9条之间,平均每对引物扩增出5.5条带,多态性比率为100%,聚类结果表明它们在70%的相似水平上归属于6个遗传组,未发现在遗传背景上完全相同的菌株。结果显示,SSR标记揭示的遗传距离大于SRAP标记。研究认为,SSR标记更适用于通过分析遗传距离以明确大豆疫霉的群体结构变化;从结合大豆品种的角度出发,使用SSR标记能较全面分析大豆疫霉的遗传多样性;结合SSR标记和SRAP标记即能从全基因组又能有重点的从功能基因组分析大豆疫霉菌的遗传多样性,对大豆疫病的抗病育种和病害控制提供理论依据。

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