收藏本站
《第二十三届中国数据库学术会议论文集(研究报告篇)》2006年
收藏 | 手机打开
二维码
手机客户端打开本文

最大子空间共调控基因聚类

赵宇海  印莹  王国仁  许光宇  王之琼  
【摘要】:提出了一种编码方案,同时聚类正共调控基因和负共调控基因.基于这种编码方式,两个正共调控或负共调控的基因都具有相同的编码,因此被聚集到同一个共调控基因类中.进一步提出了一个基于这种编码方案进行最大子空间共调控基因聚类的新算法及一些新的相关削减策略.一个最大子空间共调控基因聚类聚集了某个条件序列上的一组共调控基因,而且不被其他的子空间共调控基因聚类包含.从多方面分析了该算法的性能,并将其用于白血病和酵母细胞的真实表达数据集及人造数据集聚类.理论分析和实验结果都表明,相对于已有的基于模式/趋势的聚类算法,该算法能发现更多具有生物意义的共调控基因聚类,并且性能优于目前的共调控基因聚类算法.
【作者单位】:东北大学信息科学与工程学院
【基金】:国家自然科学基金项目(60573089,60273079,60473074)
【分类号】:TP311.13

【相似文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 程慧杰;卜宪庚;;基于基因限制信息的特征权值优化研究[J];计算机与数字工程;2011年07期
2 付淇;李正凡;;基于CLIQUE的聚类算法研究[J];华东交通大学学报;2006年05期
3 陈慧萍;王煜;王建东;;子空间聚类算法的研究新进展[J];计算机仿真;2007年03期
4 姜文瀚;周晓飞;杨静宇;;子空间样本选择及其支持向量机人脸识别应用[J];计算机工程与应用;2007年20期
5 周红福;宫学庆;郑凯;周傲英;;基于高维空间的在线高效子空间Skyline算法——CSky[J];计算机学报;2007年08期
6 葛凌云;张继福;蔡江辉;;基于微粒群和子空间的离群数据挖掘算法研究[J];系统仿真学报;2009年07期
7 张强;吴腾飞;杨颖;;基于候选对象裁剪的密度子空间聚类[J];天津大学学报;2010年07期
8 廖海斌;徐洪章;;基于鉴别主成份分析的基因表达数据特征提取[J];燕山大学学报;2010年05期
9 王庆军;张汝波;;基于Log-Gabor和正交等度规映射的人脸识别[J];计算机科学;2011年02期
10 胡泱,陈刚;一种有效的基于网格和密度的聚类分析算法[J];计算机应用;2003年12期
中国重要会议论文全文数据库 前10条
1 赵宇海;印莹;王国仁;许光宇;王之琼;;最大子空间共调控基因聚类[A];第二十三届中国数据库学术会议论文集(研究报告篇)[C];2006年
2 赵宇海;印莹;王国仁;许光宇;;挖掘微阵列数据集中的最大局部保守基因聚类[A];第二十三届中国数据库学术会议论文集(研究报告篇)[C];2006年
3 吕杰;任仙怡;张桂林;;基于局部线性嵌入和Fisher鉴别准则的目标识别方法[A];全国炼钢连铸过程自动化技术交流会论文集[C];2006年
4 徐玉峰;周丽华;肖清;;一种基于数据分布差异度的子空间聚类算法[A];第二十五届中国数据库学术会议论文集(一)[C];2008年
5 刘光杰;戴跃伟;王执铨;杨静宇;;一种基于自适应量化嵌入器的隐写方法[A];第八届全国信息隐藏与多媒体安全学术大会湖南省计算机学会第十一届学术年会论文集[C];2009年
6 金义富;朱庆生;;离群数据关键域子空间实时搜索算法[A];第二十三届中国数据库学术会议论文集(技术报告篇)[C];2006年
7 周红福;钱卫宁;魏藜;周傲英;;EDOLOIS:高效准确的子空间局部离群点发现[A];第二十届全国数据库学术会议论文集(研究报告篇)[C];2003年
8 马艳;杨长生;李志舜;;基于小波包分析和LDB的目标识别[A];2004年全国水声学学术会议论文集[C];2004年
9 郭武;戴礼荣;王仁华;;简化的信道因子估计[A];第九届全国人机语音通讯学术会议论文集[C];2007年
10 魏藜;钱卫宁;周傲英;;SLOT:基于估计的高效子空间局部离群点发现[A];第十九届全国数据库学术会议论文集(研究报告篇)[C];2002年
中国博士学位论文全文数据库 前10条
1 周红福;基于索引的Skyline算法研究[D];复旦大学;2007年
2 孙圣力;数据流上Skyline查询处理算法研究[D];复旦大学;2008年
3 孔万增;基于学习的人脸识别研究[D];浙江大学;2008年
4 贺玲;面向大规模图像库的层次化索引机制研究[D];国防科学技术大学;2006年
5 黄震华;子空间SKYLINE查询若干关键问题的研究[D];复旦大学;2008年
6 王述云;数据流频繁项挖掘与聚类分析的研究[D];复旦大学;2008年
7 王建会;中文信息处理中若干关键技术的研究[D];复旦大学;2004年
8 杨波;图驱动的无监督降维和判别子空间学习研究及其应用[D];南京航空航天大学;2010年
9 李学勇;金属标牌压印凹凸字符的特征提取和识别方法研究[D];山东大学;2008年
10 许丹;辐射源指纹机理及识别方法研究[D];国防科学技术大学;2008年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 禤世丽;基于粒子对和差分进化的基因聚类混合算法研究[D];广西师范大学;2012年
2 禤浚波;基于粒子对和极值优化的基因聚类混合算法研究[D];广西师范大学;2011年
3 苏进;一种分层聚类模型及其在电信行业的应用研究[D];合肥工业大学;2005年
4 王静;基于贝叶斯的人脸识别[D];郑州大学;2006年
5 谭坤;快速子空间追踪算法研究[D];电子科技大学;2010年
6 张东波;基于非负矩阵分解的基因数据子空间分类研究[D];西安电子科技大学;2005年
7 王洪;基于子空间的手写字符集成识别研究与应用[D];重庆大学;2003年
8 梁鹏;基于子空间的人脸图像处理与识别方法研究[D];南京航空航天大学;2002年
9 杜育林;基于信息熵的高维分类型数据子空间聚类算法研究[D];汕头大学;2011年
10 黄杰;KNNModel算法的改进及其应用[D];福建师范大学;2011年
 快捷付款方式  订购知网充值卡  订购热线  帮助中心
  • 400-819-9993
  • 010-62791813
  • 010-62985026