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《首届浙赣两省肿瘤研究交流会论文汇编》2012年
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PPAR Signaling Pathway may be an Important Predictor of Breast Cancer Response to Neoadjuvant Chemotherapy

Y.Z.Chen  J.Y.Xue  C.M.Chen  B.L.Yang  G.Y.Liu  Z.Z.Shen  Z.M.Shao  J.Wu  Q.H.Xu  F.Wu  F.Liu  X.Ye  X.Meng  
【摘要】:正Purpose Neoadjuvant chemotherapy for advanced breast cancer may improve the radicality for a subset of patients,but others may suffer from severe adverse drug reactions without any benefit.To predict the responses to chemotherapy,we performed a phaseⅡtrial of neoadjuvant chemotherapy using a weekly PCb regimen[paclitaxel (Taxol) plus carboplatin]for stageⅡ/Ⅲbreast cancer and assessed the correlation between baseline gene expression and the tumor response to treatment. Methods A total of 61 patients with stage II-Ⅲbreast cancer were included and administered four cycles of preoperative PCb.We performed a gene expression analysis using Affymetrix HG-U133 Plus 2.0 GeneChip arrays in 31 breast cancer tissues.Differentially expressed genes(DEGs) were identified by the Significance Analysis of Microarrays(SAM) program using a false discovery rate(FDR) of 0.05.The Functional Annotation Tool in the DAVID Bioinformatics Resources was used to perform the gene functional enrichment analysis.The other 30 patients(15 pCR and 15 non-pCR patients) were available as an independent validation set to test the selected DEGs by quantitative real-time PCR analysis(qRT-PCR). Results By analyzing six pathological complete response(pCR) patients and 25 patients with non-pCR,300 probes(231 genes) were identified as differentially expressed between pCR and residual disease by the SAM program when the fold change was2.The gene functional enrichment analysis revealed 15 prominent gene categories that were different between pCR and non-pCR patients,most notably the genes involved in the PPAR(Peroxisome Proliferator Activated Receptor),DNA repair and ER signal pathways and in the immune-related gene cluster.The qRT-PCR analysis results for the genes in the PPAR pathway(LPL,SORBSl,PLTP,SCD5,MMPl and CSTA) in independent validation set were consistent with the results from the microarray data analysis. Conclusion In the present study,we identified a number of gene categories pertinent to the therapeutic response. We believe that the PPAR pathway may be an important predictor of genes that are involved in the chemotherapy response.

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