广西狂犬病分子流行病学的研究

【摘要】：本研究从2000年开始从广西各地采集了1563份犬脑、4份发病牛脑、1份发病猪脑和1份猫脑组织,通过对这些动物脑组织的PCR检测,分离出38株狂犬病毒株,并对N基因3'端455个核苷酸片段进行测序分析。根据核苷酸同源性及遗传进化树分析,广西狂犬病流行毒株可分成4个群,Ⅰ群有GX01、GX08、GX09、GX014、GX019、GX091、GX123、GX173、GX174、GX195、GX260、GX443、GX510、GX520、GXSL、GXG5、GXLA、GXHX、GXGL共19株,它们的核苷酸同源性在97.6-100%之间;Ⅱ群有GX074、GX219、GX304、GX441、GX442、GX496、GX0510、GXBX、GXBM、GXQZ共10株,它们的核苷酸同源性在98.5-100%之间;Ⅲ群只有GXN119株;Ⅳ群有GX506、GX508、GX509、GX120、GXB03、GXcat、GX201、GX102共8株,它们的核苷酸的同源性在99.1-99.6%之间。通过氨基酸变异分析,与兽用疫苗株ERA比较,所有38个毒株的第58位氨基酸由P变为S,Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ群的30株共同发生了H26Y、C40S、S61N、V95L、G106D和P135S位点的变异,Ⅰ群发生了T90N和E110D、Ⅱ群发生了T42S的群特异性变异。氨基酸分析结果与核苷酸同源性、遗传进化树的分析一致。各群毒株呈现明显的地域分布特征,Ⅰ群主要分布在桂东地区、Ⅱ群主要分布在桂西地区,Ⅳ群主要分布在桂南地区。