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《2014年全国中药学术研讨会暨中国中西医结合学会第六届中药专业委员会换届改选会论文集》2014年
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预测药物和蛋白质相互作用划分天然药物化学成份升压机制的研究

贺敏  曹东升  梁逸曾  许青松  
【摘要】:一种通过化合物-蛋白质相互作用的方法被应用去评估升压机制。我们的方法假设不同升压机制的化合物应该结合到不同的靶标蛋白,因此不同的机制可以通过化合物-蛋白质相互作用予以区分。首先,与血压升高有关的天然药物成份和靶标蛋白被收集,使用一个随机森林模型计算化合物-蛋白相互作用概率,然后根据参考文献和其它方法判断可信度。从一个热图、化合物-蛋白相互作用网络图,可以清晰地观察到天然药物成份和不同的靶标蛋白的相互作用关系。最终,使用主成份分析对这些预测概率进行处理,这些升压靶标能够划分为三个大的区域。本章探索了使用化合物-蛋白质相互作用进行药理(毒理)机制分类的可行性,这个方案同时也适用于未知化合物的药理(毒理)机制推导。

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