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《2017中国长三角遗传学大会会议手册》2017年
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唐氏综合征iPS细胞中IncRNA表达改变对线粒体功能影响的研究

邱家俊  刘艳娜  刘霞  任兆瑞  颜景斌  曾凡一  
【摘要】:目的:研究唐氏综合征(Down syndrome,DS)患儿诱导多能干细胞(induced pluripotent stem cell,iPS)细胞中长链非编码RNA(long noncoding RNA,IncRNA)表达的变化,并阐释其对线粒体功能的影响。方法:分析来源于DS新生儿的iPS细胞(简称DS-iPS)与正常对照新生儿iPS细胞(简称N-iPS)的转录组测序数据,研究两组之间基因表达的变化情况,并鉴定差异表达的IncRNA和与其相关的编码基因模块及生物学功能。同时,检测DS-iPS和N-iPS细胞中线粒体功能的变化,并采用PCR-array和qRT-PCR分析线粒体功能相关基因的表达。结果:DS-iPS和N-iPS细胞中基因表达有明显差异,其中IncRNA表达的差异显著大于编码基因(Kolmogorov-Smirnov test,P0.05)。两组之间共有3749个差异表达基因,其中582个为IncRNA,这些IncRNA与线粒体功能相关模块密切相关。DS-iPS细胞中存在明显的线粒体功能异常(ATP合成降低、膜电位降低、活性氧水平升高),大部分线粒体功能相关基因表达下调(比如ATP5B,Fold Change=-8.2317;COX6A1,Fold Change=-12.7788;SLC25A17,Fold Change=-22.1296)。结论:唐氏综合征iPS细胞中IncRNA表达改变会明显影响其线粒体功能。

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