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《中国的遗传学研究——遗传学进步推动中国西部经济与社会发展——2011年中国遗传学会大会论文摘要汇编》2011年
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基于文本挖掘识别胶质瘤调控网络的核心信号

张军霞  张安玲  王颖毅  史振东  兰凤鸣  韩磊  浦佩玉  康春生  
【摘要】:恶性胶质瘤是人类最恶性、最具侵袭性的肿瘤之一,其内在机理仍没有阐明。随着生物医学研究的蓬勃发展,文本挖掘已成为为生物医学文献知识发现的新推动力。本研究采用文本挖掘胶质瘤相关基因,并针对这些基因进行GO(Gene Ontology)与pathway分析,并构建基因网络,揭示胶质瘤相关基因调控网络中核心信号。本研究通过文本挖掘构建胶质瘤基因调控网络来识别其核心信号。检索Medline摘要,文本挖掘胶质瘤相关基因,并针对这些基因行gene ontology(GO)功能分析和pathway分析,进而构建胶质瘤相关基因调控网络,从中识别胶质瘤调控网络的核心信号。结果检索到8730篇与胶质瘤相关的文章,确定与胶质瘤相关的基因总共670个。GO分析发现大多数胶质瘤相关基因涉及蛋白质结合功能、信号转导、应激反应、细胞增殖调控和细胞分化。pathway分析发现16个有统计学差异的信号通路。胶质瘤相关基因调控网络分析识别3个网络连接度高的基因PIK3CA、PIK3CB与JAK2,即PI3K与JAK2 2个核心信号。本研究首次通过文本挖掘建立胶质瘤相关基因网络,发现PI3K与JAK2信号是胶质瘤调控网络中的核心信号。

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