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《中国遗传学会第八次代表大会暨学术讨论会论文摘要汇编(2004-2008)》2008年
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家鸡胚胎性别分化前后的miRNA及其表达

白雪  刘海量  吕雪梅  
【摘要】:MicroRNA(miRNA)是一类长约22nt 的非编码 RNA,它们与靶 mRNA 分子互补结合抑制蛋白翻译或导致 mRNA 降解,从而调控靶基因表达。已有研究表明 miRNA 在动物发育、代谢等一系列生理机制中起着重要的调控作用,但还未见报道关于 miRNA 作用于性别形成和发育过程。本文家鸡胚胎为材料,分析性别分化前后(分别为4天雌雄和7天雌雄)的四个鸡胚样品中 miRNA 的表达,以探究 miRNA 在性别调控中的作用。以 Soiexa 高通量测序方法测定四个鸡胚样品的小 RNA 序列。利用已知的基因组注释信息对所得小 RNA 序列注释分类,69.91%的小 RNA 序列为已知 miRNA。对已知 miRNA 及其前体的序列进行统计分析。根据分析结果设定预测中各参数,以生物信息学方法预测 miRNA。成功预测出145个新 miRNA,其中16个可在已知数据库中找到同源序列。其余129个中24个 miRNA*也有表达,28个 miRNA*没有表达但至少在两种样品中山现。另77个基本符合预测条件作为候选。在上述研究基础上统计 miRNA 的表达量,构建表达谱并进行显著著异表达分析。分析后得到一些 miRNA 如 miR-106,miR-200a, miR-18a 等在性别分化前表达量高而分化后显著降低,一些 miRNA 如 miR-148a,h005-5p, h014-5p 等在雌雄间表达具有显著差异,表明这些 miRNA 可能在性别分化过程中起到调控作用。我们还将在进一步研究中,结合本实验室已有的基因表达芯片数据分析这些 miRNA 与靶基因的相互作用、以及它们在其他物种中的同源 miRNA 来探讨其功能和进化。

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