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《第六届动物遗传学讨论会论文集》2002年
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采用IBD方法在家畜群体中进行QTL精细定位

张勤  
【摘要】:QTL精细定位是指将QTL定位于进行1-5cM或更小的区间中,它是对QTL进行位置克隆和实现功能基因的诊断、克隆和分子操作的前提。目前QTL精细定位的主要策略是连锁不平衡定位,它是在存在QTL的区间内利用高密度标记和历史上积累的重组,根据标记与QTL之间的连锁不平衡程度来实现QTL精细定位。Riquet et al.(1999)提出了一种应用于奶牛群体的IBD(Identity byDescent)定位方法。假设影响性状的QTL的一个等位基因(Q)可追溯到N个世代前某一祖先发生的突变,则在带有相同的QTL等位基因(Q)的后代中,应携带相同的包含QTL等位基因的标记单倍型片段,即IBD片段,随着世代的延续,由于该基因与其连锁的标记等位基因不断发生重组,距离越远的标记发生重组的概率越大,后代中的IBD片段片断逐渐减小,因而有望将QTL定位在较小的片断上。本文的目的是通过Monte Carlo模拟研究标记密度、突变发生的世代数、后代数等因素对IBD定位精确性的影响。
【作者单位】:中国农业大学农业部畜禽遗传育种重点开放实验室
【分类号】:Q813

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