收藏本站
《中国细胞生物学学会医学细胞生物学学术大会论文集》2006年
收藏 | 手机打开
二维码
手机客户端打开本文

家蚕基因组的snoRNA(Box C/D)的生物信息学分析与研究

余东亮  汪旭升  徐飞  傅衍  
【摘要】:真核生物中snoRNA大致可分为Box C/D和BoxH/ACA两大类,分别指导rRNA前体的甲基化和假尿苷酸化修饰。本文采用生物信息学的方法,对家蚕基因组中的Box C/D snoRNA进行预测和分析,共获到了70个snoRNA 和56个推测的甲基化位点。 snoRNA的结构分析发现D’box和末端茎环结构的不保守性。分析snoRNA在基因组上的分布,未发现普遍的成簇分布的现象, 且内含子和基因间隔区的snoRNA数目接近,研究同时表明分布于内含子区域的某些不含标准末端茎环结构的snoRNA或许可以借助其侧翼序列行使相似功能。本文对Box C/D snoRNA的指导序列作了相似性比较,发现指导序列相似的 snoRNA指导相同rRNA进行甲基化修饰。本研究预测的结果与己报道果蝇Box C/D snoRNA进行相似性分析,表明两个物种的Box C/D snoRNAs在一级结构上有较大的差异。研究利用计算方法首次系统地对家蚕基因组中的snoRNA进行了预测和分析,有助于家蚕基因组中snoRNA以及其他ncRNA的进一步研究。

【相似文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 费建明;吴岩;占鹏飞;施国方;王文兵;;利用家蚕杆状病毒Bac-to-Bac系统表达大肠杆菌L-天冬酰胺酶Ⅱ[J];蚕桑通报;2011年02期
2 郝碧芳;王猛;沈兴家;;家蚕核型多角体病毒orf121克隆以及非翻译区分析[J];西北师范大学学报(自然科学版);2011年04期
3 庄兰芳;危浩;林健荣;钟伯雄;;家蚕hsp70启动子的克隆及功能研究[J];中国细胞生物学学报;2011年05期
4 陈睿;王在贵;杨文静;刘朝良;张宏福;唐湘方;张琛;陈敏;赵二双;李阿敏;;家蚕肠道产蛋白酶细菌的分离筛选与分子鉴定[J];中国微生态学杂志;2011年08期
5 葛俊楠;张剑韵;黄龙全;;家蚕磷酸吡哆醇氧化酶基因的表达谱分析[J];昆虫学报;2011年08期
6 丁农;张金卫;李江涛;鱼南洋;邹国平;冯世民;徐森华;;利用家蚕BmNPV生物反应器规模化生产基因工程产品的关键技术研究[J];中国蚕业;2011年03期
7 孔卫青;杨金宏;;家蚕BmNaPi基因的克隆表达与酵母穿梭表达质粒的构建[J];华北农学报;2011年03期
8 钟金凤;曹广力;薛仁宇;贡成良;;家蚕Aly/REF的基因克隆、序列分析及其细胞定位[J];昆虫学报;2011年07期
9 韩晓;;一些基因会被沉默:如同弹奏“遗传钢琴”之乐谱[J];中国生物化学与分子生物学报;2011年07期
10 汪泰初;李瑞雪;郭秋红;谭安江;;哺乳动物N-糖基化途径中关键酶唾液酸合酶和CMP-唾液酸合成酶基因在转基因家蚕中的表达[J];昆虫学报;2011年08期
中国重要会议论文全文数据库 前10条
1 余东亮;汪旭升;徐飞;傅衍;;家蚕基因组的snoRNA(Box C/D)的生物信息学分析与研究[A];中国细胞生物学学会医学细胞生物学学术大会论文集[C];2006年
2 赵红平;;家蚕蚕茧与蚕丝的生物力学研究[A];北京力学会第十六届学术年会论文集[C];2010年
3 尹德云;佟慧丽;高学军;张莉;李庆章;曲一函;;家蚕抗菌肽CecropinB基因在奶山羊乳腺上皮细胞中的表达[A];全国动物生理生化第十次学术交流会论文摘要汇编[C];2008年
4 葛红秀;解纯刚;张耀洲;;家蚕calcyphosphine基因的克隆表达及纯化[A];华东六省一市生物化学与分子生物学会2009年学术交流会论文摘要汇编[C];2009年
5 郭庆功;王保义;王子淑;;瞬态电磁脉冲对家蚕胚胎发育影响的研究[A];2001年全国微波毫米波会议论文集[C];2001年
6 郭玉娜;王仲孚;邱文龙;黄琳娟;;方便快速合成用于GC-MS分析的部分甲基化呋喃半乳糖醇乙酸酯衍生物标准[A];2008年全国糖生物学学术会议论文摘要[C];2008年
7 汲生芝;张耀州;;一个家蚕新基因的克隆表达与功能研究[A];华东六省一市生物化学与分子生物学会2009年学术交流会论文摘要汇编[C];2009年
8 Jianqiu Han;Wei Yu;Yaozhou Zhang;;家蚕真核细胞翻译起始因子BmeIF4E基因的克隆、表达及亚细胞定位研究[A];华东六省一市生物化学与分子生物学会2009年学术交流会论文摘要汇编[C];2009年
9 马良;张耀洲;;家蚕中BmIBP基因的表达分析和亚细胞定位[A];华东六省一市生物化学与分子生物学会2009年学术交流会论文摘要汇编[C];2009年
10 时连根;徐俊良;;家蚕作为生物反应器的新用途开发研究(摘要)[A];中国蚕学会养蚕与蚕生理病理学术讨论会论文汇编[C];2000年
中国重要报纸全文数据库 前10条
1 本报记者 邓力;家蚕基因破译派上大用场[N];农民日报;2003年
2 记者 邵文杰;我国开展家蚕功能基因组研究[N];光明日报;2004年
3 秦得利;家蚕基因组研究成为竞争热点[N];农民日报;2002年
4 记者 贾少强;桑蚕基因揭开家蚕起源奥秘[N];深圳商报;2009年
5 奇 云;21世纪“丝绸之路”仍从中国起步[N];大众科技报;2003年
6 过国忠;我国对家蚕功能基因组进行攻关[N];科技日报;2004年
7 汪敏华;我国开展“家蚕功能基因研究”[N];解放日报;2004年
8 王治奇;西南农大家蚕基因序列研究成绩显赫[N];农民日报;2002年
9 记者 关媛媛 李志峰;世界首张家蚕高精度遗传变异图谱绘就[N];重庆日报;2009年
10 记者 任荃;让家蚕搭载“基因组快车”[N];文汇报;2003年
中国博士学位论文全文数据库 前10条
1 于红松;家蚕黑色素合成途径基因的分子进化[D];西南大学;2011年
2 张美蓉;家蚕PcG家族分析及BmRYBP的功能研究[D];西南大学;2010年
3 牛宝龙;家蚕(Bombyx mori) triosephosphate isomerase和transformer-2基因的克隆与染色体定位研究[D];浙江大学;2005年
4 赵萍;家蚕丝氨酸蛋白酶抑制剂研究[D];西南大学;2008年
5 汪生鹏;家蚕丝素重链基因应用的相关基础研究[D];中国科学院研究生院(上海生命科学研究院);2006年
6 张永亮;野桑蚕等酚氧化酶的生化特性、基因克隆、表达及功能研究[D];西南大学;2008年
7 刘仕平;家蚕microRNAs及其节律性表达[D];西南大学;2008年
8 尚金燕;家蚕两种类型乙酰胆碱酯酶基因的分析[D];浙江大学;2006年
9 柴春利;家蚕胚胎发育相关基因的克隆、表达及功能研究[D];西南大学;2007年
10 麻鹏达;基因沉默抑制子P1/HC-Pro和P25在瞬时体系中的作用[D];东北师范大学;2007年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 黄永燕;家蚕赤蚁突变的分子定位及淡赤蚁(ch~p)的分子基础初探[D];西南大学;2010年
2 曾凤辉;家蚕新基因BmEm4的克隆,表达与功能研究[D];浙江理工大学;2010年
3 江艳;BmCycH基因及其在家蚕中表达特性的研究[D];浙江理工大学;2010年
4 潘晔;家蚕丝氨酸蛋白酶抑制剂(Bmserpin-2)和类成虫盘生长因子(BmIDGF)的亚细胞定位及组织表达分析[D];江苏大学;2010年
5 张春丽;家蚕中孕酮受体膜元件2的(PGRMC2)的表达纯化及功能初步分析[D];浙江理工大学;2010年
6 马月;家蚕凋亡相关基因BmICAD的表达及其功能研究[D];浙江理工大学;2010年
7 武慧兰;家蚕translin蛋白的初步研究[D];浙江理工大学;2010年
8 李春凤;家蚕Wibg基因的表达与定位分析功能的初步研究[D];浙江理工大学;2010年
9 甄凯旋;家蚕假想基因Bm-P312的克隆表达及其定位研究[D];浙江理工大学;2010年
10 柳学广;家蚕和野桑蚕Sex-lethal基因的研究[D];苏州大学;2007年
 快捷付款方式  订购知网充值卡  订购热线  帮助中心
  • 400-819-9993
  • 010-62791813
  • 010-62985026