【摘要】:真核生物中snoRNA大致可分为Box C/D和BoxH/ACA两大类,分别指导rRNA前体的甲基化和假尿苷酸化修饰。本文采用生物信息学的方法,对家蚕基因组中的Box C/D snoRNA进行预测和分析,共获到了70个snoRNA 和56个推测的甲基化位点。 snoRNA的结构分析发现D’box和末端茎环结构的不保守性。分析snoRNA在基因组上的分布,未发现普遍的成簇分布的现象, 且内含子和基因间隔区的snoRNA数目接近,研究同时表明分布于内含子区域的某些不含标准末端茎环结构的snoRNA或许可以借助其侧翼序列行使相似功能。本文对Box C/D snoRNA的指导序列作了相似性比较,发现指导序列相似的 snoRNA指导相同rRNA进行甲基化修饰。本研究预测的结果与己报道果蝇Box C/D snoRNA进行相似性分析,表明两个物种的Box C/D snoRNAs在一级结构上有较大的差异。研究利用计算方法首次系统地对家蚕基因组中的snoRNA进行了预测和分析,有助于家蚕基因组中snoRNA以及其他ncRNA的进一步研究。
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