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《中国细胞生物学学会医学细胞生物学学术大会论文集》2006年
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用基因芯片筛选高转移卵巢癌转移相关的基因

许沈华  牟瀚舟  顾琳慧  朱赤红  刘祥麟  
【摘要】:目的:用基因芯片技术研究高(H)转移卵巢癌细胞系(HO-8910PM) 和正常卵巢上皮(C)基因表达谱差异,筛选与卵巢癌转移相关的基因及其在染色体的定位和功能。方法:利用标准化的Affymetrix公司生产U133A基因芯片检测H 和C基因表达谱差异,并利用生物信息学方法对检测结果进行差异基因在染色体定位和功能分析。结果:高转移卵巢癌细胞株和正常卵巢上皮比较表达差异8倍以上共有1237个基因,其中表达上调(信号比的对数值[SLR]≥3)有597个,表达下调(SLR ≤-3)有640个。从表达差异的基因在染色体定位分析,发现除1个基因未知其定位外,其余所有差异表达基因散在分布在各条染色体上,但以1号染色体最多有115个(9.3%)。其次是2号染色体有94个(7.6%),第三是12号染色体有88个(7.1%)。第四是11号染色体有76个(6.1%)。第五是x染色体有71个(5.7%)。第6是17号染色体有69个(5.6%)。而异表达的基因发生在染色体短臂(q)上有805个(占65.1%),在13,14,15,21和22号仅发现在q 上有差异表达基因。从表达差异的基因分子功能分类看,属于酶和酶调控子基因最多(306个,占24.7%),其次是核酸结合基因(144个,占11.6%)。第3类是信号传导基因(137个,占11.1%)。第4类是蛋白结合基因(116个,占9.4%)。以上4大类共占基因总数.56.8%。还有功能未知的基因有207个,占16.7%。结论: 高转移卵巢癌细胞株差异表达基因散在分布在各条染色体上,但以1、2、12、11、 17和x染色体差异表达基因居多,肿瘤的转移是多基因共同作用的结果。4大类 (酶和酶调控子活性、核酸结合活性、信号传导活性、蛋白结合活性)差异表达基因是我们今后研究卵巢癌转移相关的重要基因。

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