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基于高通量测定肉鸡回肠微生物多样性及PICRUSt基因预测分析

徐帅  林奕岑  周梦佳  倪学勤  曾东  曾燕  
【摘要】:本试验旨在研究健康肉鸡回肠的微生物群落结构及功能。采用高通量测序技术对15只鸡的回肠内容物进行测序,按照97%的相似度归类OTUs,去除序列数量少的OTUs(n2),然后进行生物信息学分析及PICRUSt基因预测。结果表明:1)共获得424 062条tags,并归类于1 002个非单OTUs,样品平均tags为28 271±8 855条,平均OTUs为261±82个。2)所有样品共含有20个菌门,160个菌属。其中,共享核心菌门4个,分别是厚壁菌门(85.35%)、变形菌门(6.09%)、蓝细菌门(2.15%)和放线菌门(0.16%)。共享核心菌属19个,占样品总微生物总量的93.75%。3)鸡回肠预测得出328个功能。从前20功能热图可知,各样品的效能存在差异。由此可见,鸡回肠微生物群落复杂,但主要菌群相对稳定。本试验为进一步研究鸡回肠微生物群落结构与功能提供参考依据。

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