新城疫分离毒HN基因的分子变异特性
【摘要】:选取国内1997-2005年间分离的新城疫病毒(Newcastle disease virus,NDV)24株,经蚀斑纯化克隆其血凝素- 神经氨酸酶(HN)基因,结合在GenBank发表的36株国内外不同时期的NDV毒株,进行氨基酸遗传变异分析,并利用 SPSS8.0软件对其不同片段的氨基酸进行同源相关比较。结果显示:所有国内NDV野毒氨基酸高度同源,同源率为94.4% -99.4%;而与疫苗株LaSota的同源率为86.9%-89%;与F48E9的同源率为87.9%-89.9%。系统发育表明:国内野毒HN 遗传距离较近,而与LaSota、F48E9遗传距离较远,具有明显的年代性。比较显示国内NDV野毒均缺乏538-540位糖基化位点。
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