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《中国畜牧兽医学会2004学术年会暨第五届全国畜牧兽医青年科技工作者学术研讨会论文集(上册)》2004年
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阈性状QTL定位的系谱传递不平衡检验

丁向东  张勤  徐如海  王雅春  
【摘要】:阈性状是具有一定生物学意义和经济价值的性状,其表型分布不连续,遗传基础又与数量性状相同,由于阈性状的特殊性,传统的数量性状QTL定位方法不能有效地对其进行QTL定位。在人类疾病定位方面广泛采用的是传递不平衡检验(TDT),它以简便和高效得到了应用和扩展。但TDT只能利用独立的核心家系,对综合了父母、同胞及其它亲属信息的扩展系谱,TDT在使用时会损失大量信息,尤其在动物群体中难以应用。针对此,Martin提出了PDT方法,能有效地对人类扩展系谱进行分析。本研究在此基础上,将PDT方法移植到畜禽阈性状QTL定位中,并针对畜禽的特点,对PDT方法进行了适当修正,提出了系谱传递不平衡检验(PTDT)。利用Monte Carlo方法,模拟了多种参数组合下,PTDT的检验功效和Ⅰ型错误。结果表明,PTDT是一个稳健、有效的阈性状QTL定位方法,其Ⅰ型错误接近于显著性水平0.05(P0.05),大多数情况下,PTDT的检验功效接近于1.0。在父母信息部分缺失的情况下,PTDT的Ⅰ型错误和检验功效与未缺失时基本相同。在资料信息有限的情况下,PTDT的检验功效高于PDT,且Ⅰ型错误低于PDT。

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