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《中国植物病理学会2012年学术年会论文集》2012年
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核盘菌中发现一种新型双节段dsRNA病毒

刘立江  程家森  付艳苹  姜道宏  易先宏  
【摘要】:核盘菌(Sclerotinia sclerotiorum)是重要的作物病原真菌,寄主范围广泛,病害循环复杂,目前还缺乏安全有效的防治措施。真菌病毒在作物真菌病害的生物防治方面具有潜在的研究价值,并且还可以为研究病毒复制、进化以及与寄主互作的重要材料。本实验室在前期研究基础上,筛选出了大量可能携带真菌病毒的核盘菌菌株,其中,菌株SCH941在PDA上生长缓慢,菌落边缘扇变,产生大量色素,几乎不产菌核,致病力显著降低。进一步研究发现菌株SCH941感染了2种病毒,其中,一种是新的双节段dsRNA病毒,另一种是新的呼肠孤病毒。采用rPCR、RT-PCR、3′RACE等方法对双节段dsRNA病毒的基因组进行了克隆并获得了其基因组全长cDNA。序列分析结果表明:该dsRNA病毒基因组包括两个组分,即dsRNA-1和dsRNA-2,全长分别为6 457bp和5 965bp,GC含量分别为49.2%和49.7%。dsRNA-1只有一个开放阅读框(0RF1,nt568-6343),编码1925个氨基酸,blastx分析发现,推定的氨基酸序列只含有一个RdRP(RNA-dependent RNA polymerase)保守结构域,并且与全病毒科成员Ustilagomaydis virus-H1相似性最高;dsRNA-2也仅含有一个开放阅读框(ORF2,nt577-5848),编码1 757个氨基酸,该蛋白功能未知。dsRNA-1与dsRNA-2的末端非常保守,5′端UTR(untranslatedregion)和3′端UTR碱基相似性分别为97%和86%;另外,ORF1推定的蛋白352~811与ORF2推定的蛋白141~627区域相似性较高(e=6e~(-10),Identities=20%,Positives=38%),该区域功能未知。病毒粒子呈球形,表面光滑,直径38nm左右。通过PEG介导,病毒粒子可以侵染正常菌株的原生质体,暂时将该病毒命名为SsRV-1(Sclerotinia sclerotiorum dsRNA-1)。系统发育分析发现,该病毒与Totiviridae的成员UmV-H1有较近的亲缘关系,然而有趣的是UmVH1基因组为单组分,而SsRV-1基因组为双组分,另外,我们在核盘菌中还发现了双节段dsRNA病毒SsRV-2,SsRV-3,这种双节段RNA病毒很可能为一个新的病毒家族,其他相关研究还在进行中。

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