收藏本站
《中国植物病理学会2004年学术年会论文集》2004年
收藏 | 手机打开
二维码
手机客户端打开本文

玉米黑粉病菌基因组中的微卫星序列的组成和分布

李成云  李进斌  周晓罡  张绍松  许明辉  
【摘要】:本文利用已经公布的玉米黑粉病菌基因组测序结果,对该真菌基因组中基序为1-6碱基的微卫星(SSR)序列进行了系统地分析。结果表明,在已经公布的19.7 Mb的基因组序列中,共有6607个SSR系列(长度大于15 bp,匹配值大于80%),其碱基总数为149 363 bp,占整个基因组碱基数的0.76%,平均3.0 kb破基中就分布有一个大于15 bp的SSR序列。其中数量最多为六碱基重复序列,总长度达55806 bp,其次为三碱基重复,数量达到38679 bp,五碱基重复序列(2545 bp)。数量最少的是单碱基重复序列,只有6551 bp。

【引证文献】
中国硕士学位论文全文数据库 前1条
1 蔺宇;大豆疫霉病EST-SSR标记的开发和利用[D];吉林大学;2006年
【参考文献】
中国期刊全文数据库 前2条
1 李成云,李进斌,周晓罡,张绍松,许明辉;粗糙脉孢菌基因组中的微卫星序列的组成和分布[J];中国农业科学;2004年06期
2 李成云,李进斌,周晓罡,董爱荣,许明辉;稻瘟病菌基因组中微卫星序列的频率和分布[J];中国水稻科学;2004年03期
【共引文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 鞠玉栋,李金泉;水稻微卫星标记的发展与应用[J];安徽农业科学;2005年10期
2 海林,王克晶,杨凯;半野生大豆种质资源SSR位点遗传多样性分析[J];西北植物学报;2002年04期
3 王艳红,王辉,高立志;普通野生稻Oryza rufipogon Griff.的SSR遗传多样性研究[J];西北植物学报;2003年10期
4 谢兆辉,吴先军;水稻微卫星标记的研究进展[J];德州学院学报;2004年02期
5 陈志伟,吴为人,周元昌,景艳军;水稻细菌性条斑病抗性微卫星(SSR)标记的筛选及其在标记辅助选择中的应用[J];福建农林大学学报(自然科学版);2004年02期
6 林荔辉,陈志伟,张积森,吴为人,周元昌,唐定中;利用回交和MAS技术改良珍汕97B的白叶枯病抗性[J];福建农林大学学报(自然科学版);2004年03期
7 陈志伟,官华忠,吴为人,周元昌,韩庆典;稻瘟病抗性基因Pi-1连锁SSR标记的筛选和应用[J];福建农林大学学报(自然科学版);2005年01期
8 陈志伟,吴为人,景艳军,周元昌;利用近等基因系验证水稻细菌性条斑病抗性QTL[J];福建农林大学学报(自然科学版);2005年03期
9 陈志伟;景艳军;李小辉;周元昌;刁志娟;李生平;吴为人;;水稻细条病抗性QTL qBlsr5a的验证和更精确定位[J];福建农林大学学报(自然科学版);2006年06期
10 何风华,曾瑞珍,席章营,Akshay Talukdar,张桂权;不同Waxy基因型水稻的遗传多样性[J];分子植物育种;2003年02期
中国重要会议论文全文数据库 前7条
1 刘传光;江奕君;毛兴学;高云;刘军;林青山;李晓芳;;水稻与玉米远缘杂交改良籼稻温敏两用核不育系的SSR分析[A];2005年全国作物遗传育种学术研讨会暨中国作物学会分子育种分会成立大会论文集(一)[C];2005年
2 张启军;叶少平;虞德容;李平;吕川根;邹江石;;六张水稻遗传连锁图谱的比较分析[A];2005年全国作物遗传育种学术研讨会暨中国作物学会分子育种分会成立大会论文集(二)[C];2005年
3 余传元;赵志刚;陈平;江玲;翟虎渠;万建民;;利用CSSL群体研究水稻籼粳亚种间杂种的育性[A];提高全民科学素质、建设创新型国家——2006中国科协年会论文集(下册)[C];2006年
4 陈良兵;朱汝财;吴海滨;蒋向辉;李迪;;海南普通野生稻和山栏稻的SSR多样性比较[A];2005植物分子育种国际学术研讨会论文集[C];2005年
5 穆平;李自超;李春平;张洪亮;;水、陆稻根系性状QTL定位及其与环境互作分析[A];全国作物细胞工程与分子技术育种学术研讨会论文集[C];2003年
6 陈罡;钟鸣;徐正进;;SSR标记及其在水稻抗稻瘟病研究中的应用[A];中国植物病理学第七届青年学术讨论会论文集[C];2005年
7 李成云;李进斌;周晓罡;张绍松;董爱荣;许明辉;;稻瘟病菌阅读框架中微卫星序列的分布及所在基因功能(英文)[A];中国遗传学会七届一次青年研讨会暨上海高校模式生物E——研究院第一届模式生物学术研讨会论文汇编[C];2005年
中国博士学位论文全文数据库 前10条
1 杨蜀岚;水稻eui2基因的发现、遗传及其分子标记和定位[D];福建农林大学;2000年
2 钟代斌;水稻抗白叶枯病和抗倒伏性的分子剖析[D];中国农业科学院;2000年
3 徐建龙;应用重组自交系与近等基因导入系定位水稻数量性状位点[D];浙江大学;2001年
4 段远霖;三个水稻生殖发育突变体的形态学观察、遗传分析及有关基因的分子标记定位研究[D];福建农林大学;2001年
5 黎裕;玉米弯孢菌叶斑病抗性及其它农艺性状的QTL分析[D];中国农业科学院;2001年
6 冯英;水稻DH群体的构建与微卫星标记分析[D];浙江大学;2002年
7 彭锁堂;中国主要杂交水稻品种指纹图谱标记和鉴定技术的研究[D];浙江大学;2002年
8 滕胜;水稻产量相关生理性状的遗传分析[D];浙江大学;2002年
9 高国庆;花生微卫星DNA的分离与多态性研究[D];福建农林大学;2002年
10 孙亮先;水稻胚乳及幼苗基因表达谱的研究[D];浙江大学;2002年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 郑军;两系稻培矮64s/E32微卫星标记图谱的构建及其应用[D];福建农林大学;2001年
2 兰涛;水稻微卫星连锁图构建及稻米若干性状的QTL定位[D];福建农林大学;2001年
3 刘勇;水稻籽粒性状的遗传分析及粒长基因定位[D];四川农业大学;2001年
4 曾建平;水稻穗叶QTL分析和旱稻SSR标记多态性检测[D];中国农业科学院;2001年
5 陈粟;利用SSR标记定位水稻细条病抗性QTL[D];福建农林大学;2002年
6 王艳红;用SSR进行普通野生稻(Oryza.ruffipogan Griff)的分子群体遗传学研究[D];西北农林科技大学;2002年
7 江云珠;中国稻种(Oryza sativa L.)资源同工酶和SSR标记遗传多样性研究[D];中国农业科学院;2002年
8 马良勇;水稻有利基因的遗传分析和分子定位研究[D];中国农业科学院;2002年
9 胡国富;用微卫星及ISSR法对羊草(Aneurolepidium Chinense (Trin) Kitag)遗传多样性的研究[D];东北农业大学;2002年
10 姚明哲;太湖流域粳稻地方品种韭菜青耐盐性的遗传分析[D];南京农业大学;2002年
【同被引文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 谢吉容,向邓云,谈峰;南方红豆杉抗寒性生理指标的主分量分析[J];重庆师范学院学报(自然科学版);2002年02期
2 金基强;崔海瑞;陈文岳;卢美贞;姚艳玲;忻雅;龚晓春;;茶树EST-SSR的信息分析与标记建立[J];茶叶科学;2006年01期
3 谢福泉,谢宝贵,羿红,付瑞洲,林远崇,黄志龙,张惠珍;福建省袋栽香菇主要菌株交配型测定及品种鉴别[J];福建农林大学学报(自然科学版);2004年04期
4 宛煜嵩,王珍,肖英华,吕蓓,方宣钧;一张含有227个SSR标记的大豆遗传连锁图[J];分子植物育种;2005年01期
5 黄焕焕;张桂华;韩毅科;魏爱民;杜胜利;张显;;黄瓜作图亲本间分子标记的多态性分析[J];华北农学报;2007年02期
6 林芳灿,高国琪,张晓昱,闵家顺;香菇主要数量性状遗传率及相关性研究[J];华中农业大学学报;1993年01期
7 林芳灿,张树庭;中国香菇栽培菌株不亲和性因子的分析[J];华中农业大学学报;1995年05期
8 林芳灿,汪中文,熊再明,代江红,闵家顺;OWE-SOJ技术及核迁移试验在香菇交配型因子鉴定中的应用[J];华中农业大学学报;2000年06期
9 向长萍,谢军,聂启军,汪李平;23个苦瓜品种(系)农艺性状的主成分分析[J];华中农业大学学报;2001年04期
10 林范学,程水明,林芳灿;香菇不同交配型单核体亲本配合力的测定[J];华中农业大学学报;2004年05期
中国博士学位论文全文数据库 前4条
1 张立平;普通小麦品质性状遗传与QTL分析[D];中国农业科学院;2003年
2 张正圣;陆地棉遗传连锁图谱的构建与纤维相关性状的QTL分析[D];西南农业大学;2005年
3 兰进好;玉米强优势组合重要性状杂种优势遗传基础研究[D];沈阳农业大学;2005年
4 陈庆全;水稻抽穗开花期耐热性和重要农艺性状的遗传基础研究[D];华中农业大学;2007年
中国硕士学位论文全文数据库 前6条
1 曾建平;水稻穗叶QTL分析和旱稻SSR标记多态性检测[D];中国农业科学院;2001年
2 王化波;中国大豆疫霉菌遗传多样性和大豆种质抗病性研究[D];中国农业科学院;2001年
3 孙勇;中国香菇自然群体遗传多样性的RAPD分析[D];华中农业大学;2001年
4 王俊玲;杏鲍菇杂交亲本的筛选及F1代菌株杂种优势的预测[D];河北农业大学;2004年
5 霍云龙;大豆抗疫霉根腐病基因鉴定及分子标记[D];华中农业大学;2005年
6 任鹏飞;香菇菌株的选育及综合评价[D];华中农业大学;2006年
【二级参考文献】
中国期刊全文数据库 前1条
1 李成云,李进斌,周晓罡,董爱荣,许明辉;稻瘟病菌基因组中微卫星序列的频率和分布[J];中国水稻科学;2004年03期
【相似文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 孙典巧;孙悦娜;王日昕;徐田军;;鮸鱼EST序列中微卫星标记的初步筛选及特征分析[J];水生生物学报;2011年05期
2 ;基因组测定介绍[J];新疆畜牧业;2011年06期
3 牛伟萍;张丽颖;杨润军;张嘉保;赵志辉;张明军;;梅花鹿微卫星DNA富集文库的构建与鉴定[J];内蒙古农业大学学报(自然科学版);2011年02期
4 刘志杰;李如举;周莉;曾智勇;汤德元;王彬;甘振磊;王凤;;禽流感病毒基因组及检测方法概述[J];山地农业生物学报;2011年03期
5 张祖成;杨林;;黄瓜基因组研究进展[J];北方园艺;2011年16期
6 张艳芳;罗薇;刘内生;刘群;;鸭肝炎病毒的研究进展[J];中国畜牧兽医;2011年07期
7 魏丹丹;袁明龙;王保军;朱礼明;王进军;;两种书虱微卫星富集文库的构建及比较[J];生态学报;2011年15期
8 南文金;胡鸿惠;彭国良;娄高明;;猪瘟病毒分子生物学与致病机制研究进展[J];韶关学院学报;2011年08期
9 于树涛;王传堂;禹山林;于洪波;张建成;唐月异;王秀贞;苏君伟;;花生抗青枯病种质微卫星DNA的分离[J];核农学报;2011年04期
10 赵蕾;管宇;李坤林;于新友;沈志强;;伪狂犬病病毒分子生物学的研究进展[J];中国兽医科学;2011年07期
中国重要会议论文全文数据库 前10条
1 李成云;李进斌;周晓罡;张绍松;许明辉;;玉米黑粉病菌基因组中的微卫星序列的组成和分布[A];中国植物病理学会2004年学术年会论文集[C];2004年
2 季孔庶;李炟;;马尾松SSR引物开发[A];第六届全国林木遗传育种大会论文集[C];2008年
3 刘连盟;王玲;黄世文;;稻曲菌基因组微卫星序列的分离[A];植保科技创新与病虫防控专业化——中国植物保护学会2011年学术年会论文集[C];2011年
4 刘岳龙;秦爱建;金文杰;崔治中;叶建强;王彬;何秀苗;;鹅源腺病毒基因组E3区的鉴定和分析[A];中国畜牧兽医学会禽病学分会第十一次学术研讨会论文集[C];2002年
5 潘磊;郑鹏;徐杰;全志武;李双梅;刘宏高;柯卫东;丁毅;;磁珠富集法制备莲藕基因组的微卫星分子标记[A];第二届全国水生蔬菜学术及产业化研讨会论文集[C];2007年
6 曲妮妮;黄桂菊;喻达辉;;合浦珠母贝基因组微卫星的分离及其序列特征分析[A];中国动物学会、中国海洋湖沼学会贝类学分会第八次会员代表大会暨第十三次全国贝类学术讨论会论文摘要集[C];2007年
7 高慧棋;杨志杰;李勇;;内皮抑素基因联合~(32)P胶体对大鼠种植癌的抑制作用[A];第四届全国中青年核医学学术会议论文汇编[C];2008年
8 朱敦明;;基于基因组数据分析发现高效酶催化剂[A];中国化学会第七届有机化学学术会议图文摘要集[C];2011年
9 丁显平;;人类基因组及基因组计划[A];中国优生科学协会2004年优生科学学术交流大会论文集[C];2004年
10 李传海;赵庆华;高倩;张菲菲;徐来祥;;黑线仓鼠微卫星座位的初步筛选[A];野生动物生态与资源保护第三届全国学术研讨会论文摘要集[C];2006年
中国重要报纸全文数据库 前10条
1 记者 冯海波 通讯员 刘慧婵;华工新建“基因组科学创新班”[N];广东科技报;2009年
2 ;美国大学教授“自绘”个人基因组图谱[N];新华每日电讯;2009年
3 记者 刘传书;中国首次提出“人类泛基因组”概念[N];科技日报;2009年
4 记者 李斌;中国专家首提“人类泛基因组”[N];人民日报海外版;2009年
5 记者 马芳;华工本科生登上国际学术高峰[N];南方日报;2009年
6 记者 刘传书;庆虎年科学家启动“狮虎豹基因组计划”[N];科技日报;2010年
7 本报记者 任荃;公共基因组数据被污染了[N];文汇报;2011年
8 本报记者 刘霞;绘制基因组图:从娃娃抓起[N];科技日报;2009年
9 秦义龙;基因组时代我们如何保健[N];人民政协报;2009年
10 记者 陆健 通讯员 李军红 叶少芳;首个基因组医学研究院在温州诞生[N];光明日报;2009年
中国博士学位论文全文数据库 前10条
1 申雪艳;孔雀鱼微卫星DNA标记的研制及其遗传连锁图谱的构建[D];中国海洋大学;2007年
2 张睿;肿瘤相关基因的克隆和结构确定[D];中国协和医科大学;2000年
3 林彤;恶性黑素瘤致病机制的研究[D];中国协和医科大学;2003年
4 阮晓红;大菱鲆(Turbot)微卫星标记的筛选与应用[D];中国海洋大学;2009年
5 阎波;受体介导的肝细胞特异性单纯疱疹病毒胸苷激酶基因转移体内外研究[D];中国协和医科大学;1996年
6 赵晓航;c-myc基因表达的急剧抑制导致人食管癌细胞系的终末分化和凋亡[D];中国协和医科大学;1993年
7 杨春;猪不同组织和不同品种肌肉组织基因组DNA甲基化分析[D];吉林大学;2011年
8 赵方庆;螺旋藻基因组结构分析和藻胆蛋白的适应性进化[D];中国科学院研究生院(海洋研究所);2006年
9 张文静;微卫星DNA及ISSR技术在原生动物中的应用研究[D];中国科学院研究生院(水生生物研究所);2006年
10 侯萍;人食管癌中缺失基因片段的分离和鉴定[D];中国协和医科大学;1996年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 郭俣;大仓鼠高变异微卫星座位的筛选及应用[D];曲阜师范大学;2005年
2 郭洋;大熊猫微卫星文库的构建及物种多样性分析[D];浙江大学;2007年
3 应璐;应用毛干进行微卫星分型的初步研究[D];东北林业大学;2008年
4 李传海;黑线仓鼠(Cricetulus barabensis)微卫星引物的筛选及应用[D];曲阜师范大学;2006年
5 王艺秀;湖北钉螺(Oncomelania hupensis)微卫星DNA文库的建立及多态性位点的筛选[D];陕西师范大学;2009年
6 张述超;林麝(Moschus berezovskii)微卫星的筛选与鉴定及遗传多样性研究[D];四川大学;2007年
7 何鑫;蓝狐(Alopex lagopus)微卫星位点的筛选及遗传特征的初步评价[D];东北林业大学;2008年
8 陈微;牙鲆微卫星分子标记的筛选及多态性检测[D];中国海洋大学;2005年
9 夏珊;林麝(Moschus berezovskii)微卫星分子标记筛选及其应用研究[D];四川大学;2006年
10 贺扬;龙须菜(Gracilaria lemaneiformis)微卫星标记的筛选及品系间多态性分析[D];中国海洋大学;2008年
 快捷付款方式  订购知网充值卡  订购热线  帮助中心
  • 400-819-9993
  • 010-62791813
  • 010-62985026