煤绒菌Fuligo septica延长因子序列测定

【摘要】：煤绒菌Fuligo septica(绒泡菌科,绒泡菌目,腹黏菌亚纲)是黏菌中的一个重要的种。其子实体为复囊体,未分化出孢囊,表面有脆弱的皮层,孢丝为无色透明细管状线条连接着石灰结。张亚波(2006)认为,煤绒菌这种形态学特征暗示了该菌可能是绒泡菌目与发网菌目之间的过渡类群,而且煤绒菌属应该是绒泡菌科中相对原始的类群。陈双林(1997)的研究也认为煤绒菌是绒泡菌科中最低等的。随着分子生物学技术的发展,该技术也被不断的应用于分类与进化等研究领域。但目前GenBank中有关煤绒菌EF1A的DNA序列仅有一条,而且国内方面与之相关的分子生物学研究更是未见报道。因而本次实验通过自主设计引物的方式,扩增出煤绒菌延长因子序列,为进一步明确其在系统分类中的地位提供依据。用该引物所扩增并测得的序列长度为873bp。BLAST的比对结果显示该序列与Fiore-Donno等人在2005年发表的F.septica的序列相似度最高(相似度89%,序列覆盖率97%),表明该引物的设计是合适的。本实验不仅为煤绒菌延长因子的引物设计提供了有效的方法,更为进一步研究该菌的起源和演化提供了重要的参考依据。