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腐霉属DNA条形码初步探究

龙艳艳  韦继光  郭良栋  邓晖  
【摘要】:腐霉是世界性分布的一类菌物,有的种是植物的重要病原菌,物种的正确鉴定是腐霉流行病预报和防治的基础。作者以39种(74个菌株)为材料,结合GenBank的数据库,分析ITS、COXI、COXII、β-tubulin四个基因片段的腐霉属的种内和种间变异率,筛选适合腐霉物种鉴定的DNA条形码。研究结果表明:在分子系统发育分析中,ITS、β-tubulin和COXI三个片段序列都可将腐霉属划分为3个类群,而且与腐霉孢子囊形态(球形、丝状及介于两者之间的球形与丝状复合体)一致。但COXII建立的分子系统树结构与腐霉孢子囊的形态缺乏对应关系。ITS的种内相似率为90.6%-100%,COXII的种内相似率为96.6%-100%,β-tubulin的种内相似率为94.6%-100%,COXI的种内相似率为95.2%-100%;ITS、COXII、β-tubulin和COXI的种间相似率分别为:90.7%-100%、96.9%-99.9%、97.6%-100%和95.4%-99.8%。COXI的物种分辨率为100%,COXII和β-tubulin为97.2%,ITS为92.3%。因此COXI是腐霉属理想的DNA条形码。

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