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基于RAPD和EST-SSR标记的秀珍菇菌株聚类分析

忻雅  王伟科  阮松林  王世恒  马华升  
【摘要】:本研究利用RAPD和EST-SSR标记对10个不同来源秀珍菇菌株进行了聚类分析,并与包括菌丝生长速度及长势、子实体生长类型、出菇温度范围、转潮期等农艺性状结果进行了比较分析。在所用的200条RAPD引物中有127有扩增产物,引物可用率为63.5%。除引物S60为单态性外,其它引物可将10个菌株区分为2-6个基因型。根据从NCBI数据库中下载的含有SSR的EST序列,设计了34对EST-SSR引物,其中32对引物有扩增产物,26对显示多态性,占可用引物的76.5%,能区分出2、3、4、5、6个基因型的引物数分别为6、7、8、2、1个。根据15条RAPD核心引物和10对EST-SSR核心引物的扩增结果,对10个菌株进行了以RAPD标记、EST-SSR标记及二者相结合的聚类分析,3种聚类的结果相近,并与农艺性状分析的结果完全一致。

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