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GPU加速的蚁群算法在HP模型中的应用

林旭生  田绪红  冯志炜  陈茂资  
【摘要】:针对蛋白质二维格模型(2D HP)折叠问题提出了一种基于图形处理器(GPU)加速的蚁群算法(ACO)。通过将蚂蚁群每一步产生的构象、启发式信息、信息素等用纹理组织起来,利用 GPU 中像素着色器高度优化的并行计算能力对算法进行求解,极大地提高算法的运行效率。

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