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利用鼠疫耶尔森氏菌全基因组DNA芯片对比较基因组学、进化基因组学与生态位适应的研究

周冬生  韩延平  宋亚军  童宗中  裴德翠  戴二黑  张玲  包静月  李敏  崔百忠  张秀清  王津  郭兆彪  祁芝珍  金丽霞  翟俊辉  杜宗敏  王效义  汪建  黄培堂  杨瑞馥  
【摘要】:基于现有全基因组序列,研制了鼠疫耶尔森氏菌全基因组DNA芯片,进行了数十株鼠疫耶尔森氏菌株和假结核耶尔森氏菌的比较基因组杂交,分析了各基因在不同菌株间的差异分布,由芯片杂交结果圈定了靶标基因,扩大菌株范围进行了大规模PCR验证,得到如下结果:探明了各基因组岛在鼠疫菌和假结核菌间的差异分布,探究了鼠疫菌的起源进化;在基因组上鉴定了数十个差异区段(DFR),根据各菌株的DFR图谱,建立了鼠疫菌基因组分型系统;建立了各基因组型别间的系统发育关系,揭示了鼠疫菌基因组的进化规律及其与鼠疫菌生态位适应和鼠疫疫源地扩展之间的关系,探明了鼠疫菌在中国的演化规律。

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