收藏本站
《第十三届全国量子化学会议报告集》2017年
收藏 | 手机打开
二维码
手机客户端打开本文

Theoretical Study on Fluorescent RNA

Xin Li  
【摘要】:RNA aptamer Spinach can bind and activate a green fluorescent protein like chromophore(e.g. DFHBDI), displaying green fluorescence. Spectroscopic properties and photoisomerization mechanism in Spinach-DFHBDI complex have been investigated. The effects of RNA environment on spectral tuning and photoisomerization mechanism have been elucidated. Our simulation results show that interactions of the anionic cis-DFHBDI chromophore with two G-quadruplexes and a UAU base triple suppress photoisomerization of DFHBDI. In addition, strong hydrogen bonds between cis-DFHBDI and nearby nucleotides facilitate its binding to Spinach, and further inhibit the cis-trans photoisomerization of DFHBDI. Solvent molecules, ions,and loss of key hydrogen bonds with nearby nucleotides could induce dissociation of trans-DFHBDI from the binding site. These results provide new insights into fluorescent systems1-7 and may help rational design of other fluorescent RNAs.

【相似文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 Xin-Hua Gao;;An application of the KNND method for detecting nearby open clusters based on Gaia-DR1[J];Research in Astronomy and Astrophysics;2017年06期
2 金蔚青,何崇藩;The Growth and Melting Morphology of BSO Crystals[J];人工晶体;1988年Z1期
3 WANG You-bao;JIN Sun-jun;SU Jun;YAN Sheng-quan;LI Yun-ju;GUO Bing;LI Zhi-hong;BAI Xi-xiang;LIU Wei-ping;H.Yamaguchi;S.Kubono;D.Kahl;J.Hu;H.S.Jung;J.Y.Moon;T.Teranishi;H.W.Wang;H.Ishiyama;H.Iwasa;H.Komatsubara;;Resonant Scattering of ~(22)Na+p by Thick-Target Inverse Kinematic Method[J];Annual Report of China Institute of Atomic Energy;2012年00期
4 闫佳;冯帆;刘富成;董丽芳;贺亚峰;;Formation and dissociation of dust molecules in dusty plasma[J];Chinese Physics B;2016年09期
5 Lene Marlin;;A Place Nearby[J];校园英语(九年级版);2007年Z2期
6 K.Nakamura,Z.S.Ji,B.Shen,P.J.Qin,S.Itoh,K.Hanada,M.Sakamoto,E.Jotaki,M.Hasegawa,A.Iyomasa,S.Kawasaki,H.Nakashima;Magnetic Sensorless Sensing of Plasma Position in the Superconducting Tokamak HT-7[J];Plasma Science & Technology;2004年05期
7 小夕;;琳恩·玛莲 挪威的精灵[J];中国西部;2014年23期
8 刘建;;Love——the most important thing[J];语数外学习(初中版八年级);2007年04期
9 尚昌平;徐海波;;问玉昆仑(英文)[J];China's Ethnic Groups;2015年04期
10 ;Improvement of AMS Measurement of ~(182)Hf[J];Annual Report of China Institute of Atomic Energy;2007年00期
中国重要会议论文全文数据库 前10条
1 Xin Li;;Theoretical Study on Fluorescent RNA[A];第十三届全国量子化学会议报告集[C];2017年
2 秦和弘;;East Asian VLBI Network observations of nearby supermassive black holes[A];中国天文学会2017年学术年会摘要集[C];2017年
3 张淼淼;;A near infrared survey toward the nearby star forming regions[A];中国天文学会2014年学术年会论文摘要集[C];2014年
4 Michael Gully;;Discovery and Characterization of Young Brown Dwarfs towards Ophiuchus[A];中国天文学会2015年学术年会摘要集[C];2015年
5 Ning-Chen Sun;;Galactic Disk Bulk Motions as Revealed by the LSS-GAC DR2[A];中国天文学会2015年学术年会摘要集[C];2015年
6 M.J.Reid;K.M.Menten;;Probing the Size and Kinemat of the Milky Way with Mase[A];中国天文学会恒星分会2004年学术年会论文集[C];2004年
7 PaulA.Mayewski;;Climatological Significance ofδ~(18)O in Ice Cores, Tien Shan ,China[A];Formation and Evolution, Environmental Changes and Sustainable Development on the Tibetan Plateau[C];1998年
8 Lu Li;Haoquan Hu;Hongjun Fan;;Theoretical study on bond dissociation enthalpies of weak bridge bonds in coal[A];中国化学会第二届全国燃烧化学学术会议论文集[C];2017年
9 龙凤;;ALMA observations of protoplanetary disks in Chameleon I star-forming region[A];中国天文学会2015年学术年会摘要集[C];2015年
10 ;Semidassical Molecular Dynamics Simulation of Photo dissociation of Cyclobutane[A];中国化学会第九届全国量子化学学术会议暨庆祝徐光宪教授从教六十年论文摘要集[C];2005年
中国重要报纸全文数据库 前4条
1 上海贝尔阿尔卡特股份有限公司 王骞;Triple Play:创新融合应用[N];通信产业报;2006年
2 记者 柳一;Triple Play离我们还有多远?[N];中国电子报;2005年
3 ;Triple-play:光传送网的新任务[N];人民邮电;2006年
4 本报记者 冯雅青;桃巫奇 “任性而为”做设计[N];中国纺织报;2016年
中国硕士学位论文全文数据库 前3条
1 肖棋;双切口Triple-Endobutton钢板与锁骨钩钢板治疗急性肩锁关节脱位临床研究[D];福建医科大学;2015年
2 李洪忠;系统发生树重建的resolved triple方法[D];山东大学;2007年
3 谢如元;异型T-TEM小室在电磁兼容中的应用[D];东南大学;2006年
 快捷付款方式  订购知网充值卡  订购热线  帮助中心
  • 400-819-9993
  • 010-62791813
  • 010-62985026