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《公共安全中的化学问题研究进展(第二卷)》2011年
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京尼平的制备、晶体结构及分子旋光度密度泛函计算

孙杨  丁晓琴  丁俊杰  
【摘要】:京尼平(genipin)是一种新型的天然医用交联剂和潜在的指纹荧光显色剂。以从栀子果中提取的京尼平苷为原料,通过β-葡萄糖苷酶解后,通过活性炭脱色纯化制备得到纯京尼平及相应单晶。通过单晶X射线法确定了它的立体结构晶体结构分析表明:单斜晶系,P2(1)空间群。a=0.75670(15)nm,b=1.7759(4)nm,c=0.81709(16)nm,α=90°,β=93.92(3)°,γ=90°,V=1.0954(4)nm~3,Z=4,F(000)=480,Mr=226.22,Dc=1.372g/cm~3,μ(Mo Kα)=0.109 mm~(-1),R_11=0.0647,wR_2=0.0909。分子中的三个手性中心分别为C3(S)、C2(S)和C1(R)构型,分子间形成多个氢健。进一步利用密度泛函DFT/B3LYP量子化学计算方法,通过势能面扫描和构象分析,计算了九种3cal/mol以内构象的分子旋光度,经Boltzmann统计平均得[α]_(589.3)~(25)nm=-115.01(aug-cc-pVDZ),计算结果与实验结果基本一致(实验值为121°)。进一步证实了分子的旋光度的计算可以帮助有机药物化学家确定天然产物分子的绝对构型
【作者单位】:防化指挥工程学院一系 北京药物化学研究所
【分类号】:TQ422

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