收藏本站
收藏 | 手机打开
二维码
手机客户端打开本文

基于结构的虚拟筛选方法及其在全新CD38受体抑制剂发现中的应用

司原琦  刘振明  张亮仁  
【摘要】:CD38分子是ADP核糖环化酶家族一种Ⅱ型跨膜糖蛋白。作为一种多功能信号酶,它广泛表达于多种组织和细胞中。CD38分子在体内能够催化β-NAD+(β-烟酰胺腺苷二核苷酸)和NADP(烟酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸)生成具有钙动员活性的第二信使核苷酸小分子:环腺苷二磷酸核糖(cADPR)和烟酸腺苷二核苷磷酸(NAADP)等。通过作用于人体相关受体系统,这些Ca~(2+)信使实现在生理条件下调控细胞内钙库钙离子的释放和外钙的内流,从而调节细胞的功能与生命活动的进行。发展新的CD38抑制剂作为药理学工具药有助于研究CD38的催化机制,可能在一些疾病的治疗上有潜在的作用。本文采用了基于结构的虚拟筛选方法来寻找新结构类型的CD38抑制剂。首先基于晶体结构(图一)搭建了药效团模型(图二)作为提问结构筛选小分子数据库,接着用分子对接评价命中分子与蛋白的结合。根据得到的结合模式并考虑到分子结构多样性挑选出了命中分子。在已完成活性测试的分子当中,有三个分子IC_(50)在微摩级别,与现有抑制剂活性相当。

知网文化
【相似文献】
中国期刊全文数据库 前20条
1 杨志瑜;吕炜;田然;金宏威;曾慧慧;;5-羟色胺1A受体配体发现新思路:基于受体的药效团(英文)[J];Journal of Chinese Pharmaceutical Sciences;2009年02期
2 叶德举;罗小民;沈建华;朱维良;沈旭;蒋华良;柳红;;先导化合物的发现——整合计算机虚拟筛选、化学合成和生物测试方法[J];化学进展;2007年12期
3 刘艾林;杜冠华;;虚拟筛选辅助新药发现的研究进展[J];药学学报;2009年06期
4 董光;邓学娟;;整合药效团的分子对接方法研究[J];计算机应用与软件;2011年10期
5 刘廷林;谢焕章;魏于全;杨胜勇;;探索应用反向对接技术研究蛋白激酶抑制剂选择性的可行性[J];药学学报;2009年07期
6 李洪林,沈建华,罗小民,沈旭,朱维良,王希诚,陈凯先,蒋华良;虚拟筛选与新药发现[J];生命科学;2005年02期
7 王伟;沈生荣;冯凤琴;何国庆;王占黎;;基于药效团的血管紧张素转换酶抑制肽的结构优化[J];中国科学(B辑:化学);2008年04期
8 李敏勇;夏霖;;基于受体的合理药物设计在α_1-肾上腺素能受体拮抗剂中的应用[J];中国药科大学学报;2006年02期
9 刘述;李东培;周丽华;;评价不同的打分函数对虚拟筛选β-分泌酶抑制剂富集率的影响[J];解剖科学进展;2010年03期
10 缪有盼;李爱秀;刘涛;吴可柱;马翼;;基于“底物包膜”假说筛选新型HIV-1蛋白酶抑制剂[J];化学学报;2009年10期
11 蒋玉仁;许慧;陈芳军;马贯军;;乙酰胆碱酯酶抑制剂Corydaline的分子对接与开环衍生物的虚拟筛选[J];物理化学学报;2009年07期
12 王光凤;黄牛;孟志宏;刘全海;;应用虚拟筛选方法寻找链阳霉素A乙酰转移酶抑制剂(英文)[J];药学学报;2007年01期
13 罗小民,蒋华良,沈建华,陈凯先;药物分子设计研究进展[J];中国科学院院刊;2003年04期
14 葛月宾;王丽君;廖矛川;;计算机辅助药物设计的应用[J];科技创业月刊;2008年12期
15 李敏勇,卢景芬,夏霖;拮抗状态下α_(1A),α_(1B)和α_(1D)-肾上腺素能受体的分子模拟研究[J];化学学报;2005年20期
16 苏青;周鲁;;基于结构的组合库设计在AⅡ受体拮抗剂中的应用[J];药物分析杂志;2007年07期
17 唐玉焕;林克江;尤启冬;;基于2D分子指纹的分子相似性方法在虚拟筛选中的应用[J];中国药科大学学报;2009年02期
18 李顺来;李秀艳;杜洪光;;COX-2/DHODH双重抑制剂存在可行性的初步对接虚拟筛选研究[J];北京化工大学学报(自然科学版);2008年06期
19 阎作伟,胡远东,李松,江涛;肝素与HIV-1膜表面蛋白gp120相互作用的预测和模拟[J];高等学校化学学报;2004年03期
20 徐志广;许旋;袁传能;;紫杉醚与αβ微管蛋白的分子对接[J];物理化学学报;2008年10期
中国重要会议论文全文数据库 前10条
1 司原琦;刘振明;张亮仁;;基于结构的虚拟筛选方法及其在全新CD38受体抑制剂发现中的应用[A];第十届全国计算(机)化学学术会议论文摘要集[C];2009年
2 赵文霞;黄丹娥;方坚松;顾琼;徐峻;;基于结构与配体的肝X受体调控剂的设计与筛选[A];中国化学会第28届学术年会第14分会场摘要集[C];2012年
3 杨娜;王庆河;李凤;程卯生;;IMPDH抑制剂的虚拟筛选研究[A];2011年中国药学大会暨第11届中国药师周论文集[C];2011年
4 朱维良;;虚拟筛选策略的再探索[A];中国化学会第27届学术年会第15分会场摘要集[C];2010年
5 宫丽丽;方莲花;杜冠华;;结合虚拟筛选和高通量筛选方法寻找Rho激酶抑制剂[A];药学发展前沿论坛及药理学博士论坛论文集[C];2008年
6 初燕燕;陈显军;杨弋;唐赟;;虚拟筛选方法用于寻找Ero1p的小分子抑制剂[A];第十一届全国计算(机)化学学术会议论文摘要集[C];2011年
7 代英杰;王新宇;王大伟;康从民;;苯并咪唑类血管内皮生长因子受体-2抑制剂药效团模型的构建与应用[A];2011年全国药物化学学术会议——药物的源头创新论文摘要集[C];2011年
8 鲍红娟;唐亚林;徐筱杰;向俊峰;郑智慧;路新华;;二氢乳清酸脱氢酶抑制剂药效团模型的构建[A];中国化学会第27届学术年会第15分会场摘要集[C];2010年
9 李剑;张键;陈静;贵春山;柳红;沈旭;蒋华良;陈凯先;;亲环素A抑制剂的发现:综合运用基于结构的虚拟筛选,基于碎片的化合物库设计,化学合成和生物测试[A];“以岭医药杯”第八届全国青年药学工作者最新科研成果交流会论文集[C];2006年
10 杨帆;刘艾林;;分子对接应用与研究进展[A];药学发展前沿论坛及药理学博士论坛论文集[C];2008年
中国博士学位论文全文数据库 前10条
1 董爱国;RXR药效团模建和分子对接研究[D];天津大学;2009年
2 许哲军;GPCR配体药效团模拟及其数据库构建研究[D];华东理工大学;2012年
3 于红;基于脂肪酸合成酶FabH结构的抗菌药物的设计、合成与筛选[D];中国人民解放军军事医学科学院;2005年
4 朱杰;基于抗真菌药物新靶点的计算机辅助药物设计研究[D];第二军医大学;2006年
5 史喆;分子对接与核磁共振方法筛选人双特异性磷酸酶VHR抑制剂的研究[D];中国科学技术大学;2007年
6 周新明;肿瘤坏死因子-α抑制剂的设计、合成与筛选[D];沈阳药科大学;2007年
7 刘瑶;基于CCR5结构的HIV-1穿入抑制剂的设计、合成与筛选[D];吉林大学;2008年
8 成碟;噻吩并吡啶类衍生物的设计、合成、活性评价及其药效团模型[D];天津大学;2009年
9 胡国平;虚拟筛选方法评价和靶向HIV-1整合酶与人类LEDGF/p75蛋白相互作用界面的抑制剂发现研究[D];华东理工大学;2012年
10 陶国新;基于HIV-1蛋白酶结构的非肽抑制剂的全新分子设计与合成[D];中国协和医科大学;2001年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 白崇亮;PI3K亚型选择性抑制剂的药效团分析及以PI3K为靶点的虚拟筛选[D];兰州大学;2012年
2 方菁;基于雌激素受体和组蛋白去乙酰化酶的药物分子设计研究[D];华东理工大学;2011年
3 金芳芳;基于糖尿病相关靶标β_3-AR和GLP-1R的药物设计研究[D];华东理工大学;2012年
4 陈仕高;基于stitch数据库的老年痴呆药物虚拟筛选[D];上海交通大学;2012年
5 杨晔;抗病毒相关药效团的构建及评价方法研究[D];北京中医药大学;2010年
6 阮钶茵;异构网格环境下分子对接应用的关键问题研究[D];兰州大学;2012年
7 洪渊;基质金属蛋白酶及其抑制剂的分子对接研究[D];吉林大学;2007年
8 赵晓宇;药物分子对接的优化模型与算法[D];大连理工大学;2008年
9 刘燕茹;进化算法在分子对接中的研究与应用[D];天津师范大学;2009年
10 何献卓;整合酶药效团模型构建及芳香二酮类化合物的设计与合成[D];北京工业大学;2012年
中国重要报纸全文数据库 前10条
1 刘春英;掌握理论技术 推进源头创新[N];中国医药报;2009年
2 马云;我国学者发明抗HIV药高通量筛选新法[N];中国医药报;2008年
3 记者 白毅;建立三种新药筛选平台并确定相关产物结构[N];中国医药报;2006年
4 程卯生;创新药物研究亟须解决关键科学问题[N];中国医药报;2007年
5 白毅;我国研发出靶标发现新方法[N];中国医药报;2008年
6 王雪飞;抗2型糖尿病新药有苗头[N];健康报;2004年
7 李和平;中国医科院药物所整合多学科研究抗炎新药[N];中国医药报;2005年
8 齐继成;条条大路通罗马[N];医药经济报;2002年
9 记者 杜学静;专家建议发展生物中药[N];经济参考报;2003年
10 王兴;闫智勇;郝晓锋;中药新药筛选新思路[N];中国医药报;2004年
中国知网广告投放
 快捷付款方式  订购知网充值卡  订购热线  帮助中心
  • 400-819-9993
  • 010-62982499
  • 010-62783978