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《第十届全国计算(机)化学学术会议论文摘要集》2009年
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基于一级结构信息预测蛋白质与蛋白质相互作用

李占潮  周漩  戴宗  邹小勇  
【摘要】:蛋白质与蛋白质相互作用对于包括DNA的转录与复制、信号转导、基因调控、细胞周期控制、免疫识别、酶催化以及新陈代谢在内的生命现象都具有重要的调控作用[1-3]。因此,正确的识别蛋白质与蛋白质相互作用,不仅对于蛋白质功能注释,而且对于新药的研究都具有重要的作用。本文仅基于蛋白质一级结构信息,利用特征选择方法和支持向量机技术对蛋白质与蛋白质相互作用进行了预测。对Guo[4]等建立的标准数据集进行了5-fold交叉验证,结果如表1所示,最高的预测精度达到了96.57%,优于现有文献报道方法,表明了当前方法的有效性。
【作者单位】:中山大学化学与化学工程学院
【基金】:国家自然科学基金资助项目(No.20575082)
【分类号】:Q51

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