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《渔业科技创新与发展方式转变——2011年中国水产学会学术年会论文摘要集》2011年
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鲫鱼肠道微生物区系及其来源分析

吴山功  田静云  李文祥  邹红  杨宝娟  王桂堂  
【摘要】:肠道细菌群落影响宿主的生长,食物转化,上皮发育,免疫以及病原微生物在肠道的建立。因此,肠道微生物受到了越来越多的关注。本研究用焦磷酸测序(pyrosequencing)的方法详细研究了鲫(Carassius auratus gibelio)消化道微生物区系及其来源。研究结果显示鲫消化道和养殖环境栖息着复杂的微生物类群,其中变形菌门(Proteobacteria)是最主要的类群,然后是厚壁菌门(Firmicutes)和放线菌门(Actinobacteria),而拟杆菌门(Bacteroidetes)只占很小的比例。潜在的益生菌(乳酸杆菌属Lactobacillus,乳球菌属Lactococcus和芽孢杆菌属Bacillus)和病原菌(气单胞菌属Aeromonas和不动杆菌属Acinetobacter)在肠道中低丰度但稳定存在。细菌群落比较分析显示鲫肠道菌群与底泥微生物群落最相似,表明底泥细菌群落是影响鲫肠道菌群的最重要的因子。然而,饲料中37.95%OTUs出现的肠道中,说明食物中的细菌明显的影响鲫肠道微生物区系,益生菌可以添加到饲料中。
【作者单位】:中国科学院水生生物研究所 国家海洋中心
【分类号】:S917.1

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