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《中国棉花学会2011年年会论文汇编》2011年
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陆地棉胞质雄性不育系与保持系线粒体SCAR分子标记

张晓  张锐  史计  王远  孙国清  孟志刚  周焘  郭三堆  
【摘要】:陆地棉胞质雄性不育(CMS)系P30A已应用于杂交棉制种的生产实践,但该不育系及其保持系的分子标记尚不丰富,有必要开发新的分子标记。在克隆棉花atpA基因时发现,P30A与其保持系P30B线粒体基因组中各存在两个atpA拷贝:一个全长拷贝和一个3′截短型拷贝。P30B中,全长atpA拷贝3′下游存在一段nad6基因的编码序列,该序列对应nad6编码区的第+509-+590bp区域;P30A中,全长atpA拷贝3′下游存在同样的一段序列,同时在P30A截短型拷贝的3′下游也存在一段nad6基因序列,该序列对应nad6编码区的第+552-+578bp区域。我们将散布在atpA基因下游的这些nad6编码序列称作"短重复序列",则:在P30B中,只有全长atpA拷贝的3′下游存在一段"短重复序列";而在P30A中,全长和截短型atpA拷贝的3′下游各存在一段"短重复序列"。根据这种情况,我们以atpA核心编码区的一段序列做为正向引物,以这段"短重复序列"(对应nad6编码区的第+552-+578bp区域)做为下游引物,分别以P30A和P30B总DNA为模板进行PCR扩增,结果从P30B中扩增出一条带(594bp),从P30A中扩增出两条带(594bp和794bp)。然后选取P30A-CMS系统中的其他不育系和保持系进行验证,发现该标记的扩增结果很稳定,表明该标记可准确、简便地鉴定陆地棉CMS系和保持系。

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