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《江苏省遗传学会2017年学术研讨会——“技术创新与遗传学发展”论文摘要集》2017年
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鳙早期发育阶段的转录组分析

张丹  傅建军  朱文彬  王兰梅  方敏  董在杰  
【摘要】:鳙(Hypophthalmichthynobilis)是我国重要的大宗淡水鱼之一,具有悠久的养殖历史。目前,研究人员从分子水平开展个体早期发育等方面的基础研究开展较少,对鳙的胚胎和幼苗发育过程的分子调控机理知之甚少。基于此本实验借助高通量测序技术,对鳙胚胎发育和幼苗发育阶段开展转录组测序(RNA-seq),探索鳙早期发育过程中转录水平的变化。通过对鳙3个胚胎发育时期(桑葚期、肌节出现期和肌肉效应期)和3个幼苗发育时期(出膜后0.5h、12h和24h)共6个早期发育时期样本进行转录组测序,再经过测序数据过滤后的分别获得43278924,42334044,42614072,43283178,43272948,43788112条数量统计,使用FPKM法估算基因表达水平,发现肌肉效应期和出膜24h后基因表达水平较高。通过对样本进行相关性分析,发现样本间的相关性与样本间发育程度的差异性呈负相关,同时出膜后各发育阶段样品之间的相关性大于出膜前。早起发育阶段的差异表达基因的发现,为机理研究提供数据基础。

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