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《江苏省遗传学会第九次会员代表大会暨学术研讨会论文集》2015年
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水稻芒长QTL qAn4.1的精细定位研究

魏伟  王刘军  陶亚军  缪军  周勇  梁国华  
【摘要】:水稻芒性状是一个重要的驯化相关性状,是由多基因控制的数量性状,遗传基础复杂,易受环境影响。虽然已有较多报道对控制水稻芒性状基因和QTL进行了初步定位,但对芒基因进行精细定位和克隆的只有An-1,仍不能充分了解芒形成机理和水稻驯化过程。本研究从一套以籼稻品种9311为受体、粳稻品种日本晴为供体构建的128个染色体片段代换系中,发现了一个芒长较轮回亲本9311显著增长的代换系C12061。为了解释其表型变化的遗传基础,我们将代换系C12061与9311回交并自交,获得F2/F3分离群体,用于鉴定控制水稻芒增长的主效QTL,并完成其遗传分析和精细定位。代换系供体亲本日本晴表现为无芒,受体亲本9311表现为部分短小顶芒,代换系C12061表现出芒长的变异,我们推测可能是由于日本晴代换片段的插入导致。C12061表现为长芒,其平均芒长为4.5cm,9311表现为短芒,其平均芒长为0.6cm。衍生分离群体表现出芒长的分离,遗传分析表明,芒长的分离比符合3:1的单个孟德尔因子分离规律(χ~2=1.52χ_(0.05)~2=3.84),表明芒长的分离受单个主效QTL控制,我们将其命名为qAn4.1,长芒对短芒为显性。根据代换系的重测序结果,利用17对覆盖代换片段的多态性标记对C12061和9311进行多态性筛选,并通过遗传连锁分析,初步将控制芒长的QTL定位于第4染色体标记RM17182和RM17305之间,物理距离约为2.3Mb的区段内。为了进一步精细定位q An4.1,在标记RM17182和RM17305之间区段不同的BAC克隆上共发展了21对有多态性的Indel和CAPs标记。利用F3分离群体的1615个隐性单株,最终将qAn4.1定位在标记S4-364和caps-1之间,物理距离约为55.6kb。根据NCBI网站上公布的预测信息可以知道,在这个55.6kb的区间范围内共有5个候选基因(Os04g0517900,Os04g0518000,Os04g0518100,Os04g0518200,Os04g0518400),这为最终克隆目标基因奠定了基础。
【分类号】:S511

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1 魏伟;王刘军;陶亚军;缪军;周勇;梁国华;;水稻芒长QTL qAn4.1的精细定位研究[A];江苏省遗传学会第九次会员代表大会暨学术研讨会论文集[C];2015年
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