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结合消减杂交筛选肝癌细胞系中差异甲基化位点

樊红  程欲超  赵主江  权艳梅  成建  
【摘要】:为探索有效分离两样品间差异甲基化片段的方法,以DNMT1(DNA methyltrans ferase1,DNMT1)表达抑制前后的肝癌细胞系7721-sMT1和7721-pMT1为研究对象,结合消减杂交和磁珠分离的方法,在两细胞系全基因组DNA范围内进行扫描差异性甲基化片段;将这些片段进行生物信息学分析,发现所获38条差异甲基化片段分布于不同的染色体上,但集中于重复序列、基因的启动子区,此特点符合DNA甲基化位点分布规律。实验结果证明消减杂交结合磁珠分离的方法能够筛选出两样品间的差异甲基化片段,该方法的建立为筛选肿瘤细胞中特异性差异甲基化片段作为肿瘤诊断的标志物提供了可能性。

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