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《中国蛋白质组学首届学术大会论文摘要集》2003年
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腾冲嗜热菌蛋白质组数据库(TPB)的开发与利用

汪浩  李宇驰  陈晔  洪星  段举  李涛  王敬强  殷剑宁  刘斯奇  
【摘要】:正 腾冲嗜热菌是发现于我国云南腾冲地区温泉中的一种杆状、厌氧型革兰氏阴性真细菌。其全基因组测序已经完成,大小为2,689,445bp,理论预测基因数目为2588个。在此基础上,我们开展了该菌的蛋白质组测定,力图通过全面了解高温条件下腾冲嗜热菌的蛋白质表达水平,进一步探讨嗜热菌的生存的分子机理。按照实验设计,我们采用三种不同蛋白质组分析方法(shotgun-LC/MS、2DE-MALDI-TOF-MS、1DE-LC/MS),从不同的角度去测定细菌的蛋白质。通过实验产生了大量的数据,而对这些数据的后期分析工作更是异常艰巨,因此,与此相适应的是,我们开发出了一个数据库系统来完成对海量数据的处理和分析。

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