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《中国计算机图形学进展2008--第七届中国计算机图形学大会论文集》2008年
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基于分子力学的蛋白质分子场可视化

汪莉  万华根  彭群生  
【摘要】:分子场是研究分子结构与功能的重要工具之一,已经成为药物设计和分子对接的常规方法。分子间作用力分布在三维空间,现有的蛋白质显示方法,如范德华表面,分子表面,球棍模型等等,都难以对分子间作用力进行空间可视化分析。分子间各种相互作用中,静电力和范德华力在许多生物过程中都扮演着重要的角色,对蛋白质静电相互作用和范德华相互作用的正确计算模拟有着重要的理论和实践意义。本文从蛋白质分子结构出发,经过分子模拟采样计算得到分子场,再对分子场进行可视化分析,提出针对分子场特点的分步式传输函数设计法,直观地反映了分子场在空间的分布,对于分析蛋白质结构功能、了解分子间相互作用机理以及进行药物设计和分子对接都有重要作用。
【作者单位】:浙江大学CAD&CG国家重点实验室
【分类号】:Q51

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