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《基因开启未来:新时代的遗传学与科技进步——湖北省遗传学会第八次代表大会暨学术讨论会论文摘要汇编》2009年
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比较基因组学研究方法——真菌基因组比较分析为例

曾昭清  余知和  
【摘要】:阐明各种生物基因组DNA序列信息及破译相关遗传学背景的基因组学是生物学和医学研究的核心学科。随着人类基因组计划的完成,基因组研究在生物学和医学领域越来越受到重视。测序技术的快速发展,使越来越多的基因组研究项目在进行,于是,比较基因组学作为一种重要的工具学科应运而生。该学科的发展与基因组数据的积累密切相关,目前已经成为研究生物基因组的最主要手段之一。至2009年10月30日,国际上有1127种(古菌70种,细菌938种,真核生物119种)(http://www.genomesonline.org/)生物全基因组序列公开发布。本研究利用Aspergillusnidulans的每个基因序列和30种已经发布的子囊菌全基因组进行比较用来研究序列同源性,过程包括Blastall平台构建、Local数据库建立、全基因组分割为单基因序列、数据库中同源序列查询与比较结果获得以及根据研究目的确定不同的E值范围用于进一步研究。
【作者单位】:长江大学生命科学学院
【分类号】:Q75

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