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基于极大似然估计的分子序列修正Kimura双参数距离

蔡旭  方伟武  
【摘要】:在目前分子序列比较的研究中,Kimura双参数距离是应用很广的一种距离,然而该距离公式对从实际分子序列得来的两种类型碱基对的数目P和Q有一定的取值限制.本文在描述分子序列进化的Kimura双参数模型的基础上,利用极大似然估计法估计该模型的两个参数——transition替代率α和transversion替代率β,并由此得出修正Kimura距离,克服了传统Kimura距离中对P和Q的取值限制.

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