收藏本站
《中国运筹学会第六届学术交流会论文集(下卷)》2000年
收藏 | 手机打开
二维码
手机客户端打开本文

隐马尔可夫模型与剪切位点识别

杨文强  邓明华  钱敏平  
【摘要】:识别编码基因序列是生物信息学中的一个公开问题。基因识别的关键是预测出基因结构中外显子(exon)与内含(intron)之间的剪切位点(splicing site)。本文引入统计学中的隐马尔可夫过程,对剪切位点中的供点(donor site)区域建立相应的模型,通过自学习之后,得到隐马尔可夫模型的重估参数,用以识别DNA序列中的剪切位点。
【作者单位】:北京大学数学学院 北京大学数学学院 北京大学数学学院
【分类号】:O211.9

【引证文献】
中国期刊全文数据库 前1条
1 杨王黎;许少华;;利用条件随机场实现DNA剪接位点的预测[J];重庆大学学报;2010年10期
【同被引文献】
中国期刊全文数据库 前4条
1 夏慧煜,周晴,李衍达;隐Markov模型在剪接位点识别中的应用[J];清华大学学报(自然科学版);2002年09期
2 曹胜玉;刘来福;;隐马模型及其在基因识别中的应用[J];数学的实践与认识;2006年09期
3 杨乌日吐;李前忠;刘利;樊国梁;;用支持向量机预测人类基因5′/3′选择性剪切位点[J];现代生物医学进展;2007年05期
4 李骜,王涛,冯焕清,王明会;基于贝叶斯网络的DNA序列剪接位点预测[J];生物物理学报;2003年04期
【二级引证文献】
中国硕士学位论文全文数据库 前1条
1 曹锦;条件随机场在基因剪接位点预测中的应用研究[D];福建农林大学;2012年
【相似文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 周德华;袁书娟;兰景涛;;关于隐马尔可夫模型的一个极限性质[J];科技信息(学术研究);2008年32期
2 祝伟华;卢熠;刘斌斌;;基于HMM的Web信息抽取算法的研究与应用[J];计算机科学;2010年02期
3 杨卫国;纪灵军;孙杰;;关于m重隐非齐次马尔可夫模型的混合性[J];江苏大学学报(自然科学版);2009年06期
4 罗泽举;宋丽红;;隐马尔可夫模型的多序列比对研究[J];计算机工程与应用;2010年07期
5 谢贤亚,朱强,李焕润;基于隐马尔可夫模型的多频率线跟踪算法的若干改进[J];信息与控制;1997年06期
6 张冬青;宁宣熙;刘雪妮;;隐马尔可夫模型在经济预测中的应用[J];企业经济;2007年07期
7 陈文锋;李兵;武海锋;;基于最大互信息的连续型隐马尔可夫模型参数训练方法[J];云南大学学报(自然科学版);2006年S1期
8 余文利;廖建平;马文龙;;一种新的基于隐马尔可夫模型的股票价格时间序列预测方法[J];计算机应用与软件;2010年06期
9 文凤春;金人超;肖枝洪;;训练隐马尔可夫模型的BW-GA方法[J];计算机工程与应用;2010年17期
10 吴小太;杨卫国;;隐非齐次马尔可夫模型的强大数定律[J];数学杂志;2011年02期
中国重要会议论文全文数据库 前4条
1 杨文强;邓明华;钱敏平;;隐马尔可夫模型与剪切位点识别[A];中国运筹学会第六届学术交流会论文集(下卷)[C];2000年
2 李玉;;半隐马尔可夫模型[A];科技、工程与经济社会协调发展——中国科协第五届青年学术年会论文集[C];2004年
3 崔欣辰;曲宁;陈青华;;隐马尔可夫模型在Web信息抽取中的几点改进[A];全国第4届信号和智能信息处理与应用学术会议论文集[C];2010年
4 陆汝华;杨胜跃;樊晓平;;基于CGHMM的轴承故障音频信号诊断方法[A];第二十六届中国控制会议论文集[C];2007年
中国博士学位论文全文数据库 前2条
1 赫泉玲;多元小波的构造、提升及其应用[D];吉林大学;2005年
2 李嵩松;基于隐马尔可夫模型和计算智能的股票价格时间序列预测[D];哈尔滨工业大学;2011年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 纪灵军;隐非齐次马尔可夫模型的混合性[D];江苏大学;2008年
2 王佳;对于非参数隐马尔可夫模型的平滑度选取[D];东北师范大学;2009年
3 侯雅文;基于隐马尔可夫模型的股票价格指数预测[D];暨南大学;2007年
4 郭美平;隐非齐次Markov模型的若干强极限定理[D];江苏大学;2009年
5 王国刚;n阶隐马尔可夫模型的参数估计[D];南京邮电大学;2011年
6 孙春生;隐马尔可夫模型下基于通信流的隐组识别[D];西安电子科技大学;2009年
7 宋文静;基于隐马尔可夫模型的音频检索[D];南京理工大学;2004年
8 严博;动态客户关系管理下隐马尔可夫建模及实证[D];电子科技大学;2006年
9 姚世通;基于隐马尔可夫模型的时间序列聚类的研究[D];上海交通大学;2011年
10 彭志行;马尔可夫链理论及其在经济管理领域的应用研究[D];河海大学;2006年
 快捷付款方式  订购知网充值卡  订购热线  帮助中心
  • 400-819-9993
  • 010-62791813
  • 010-62985026