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《中国电子学会第十六届信息论学术年会论文集》2009年
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RNA序列结构比对算法综述

陆斌  骆志刚  苏光龙  丁凡  
【摘要】:RNA序列结构比对是生物信息学中的基本问题。本文介绍目前解决RNA序列结构比对问题的主要数学模型和算法思想,对算法进行分类和比较。最后,指出已有比对算法中存在的主要问题,对该领域进一步研究内容进行了展望。
【作者单位】:国防科学技术大学计算机学院
【基金】:国家自然科学基金资助项目(60673018)~~
【分类号】:TP399-C8

【参考文献】
中国期刊全文数据库 前2条
1 梁栋,霍红卫;自适应蚁群算法在序列比对中的应用[J];计算机仿真;2005年01期
2 敖友云;迟洪钦;;基于遗传算法的一种生物序列比对方法[J];计算机工程与设计;2006年19期
【共引文献】
中国期刊全文数据库 前5条
1 王芳芳;马志强;王素华;;基于遗传算法的序列比对方法[J];吉林大学学报(信息科学版);2006年04期
2 肖冰;李洁;高新波;;一种度量图像相似性和计算图编辑距离的新方法[J];电子学报;2009年10期
3 申德荣;刘丽楠;寇月;聂铁铮;于戈;;一种面向Deep Web数据源的重复记录识别模型[J];电子学报;2010年02期
4 张淑萍;;自适应蚁群算法在DNA序列比对中应用研究[J];计算机仿真;2012年06期
5 何玲娟;刘连臣;吴澄;;结构化Web服务的松弛匹配[J];清华大学学报(自然科学版);2011年03期
中国重要会议论文全文数据库 前2条
1 郑仕辉;何奇;张龙;梁宇奇;周傲英;;XML文档的相似测度研究[A];第十八届全国数据库学术会议论文集(研究报告篇)[C];2001年
2 王桐;刘大昕;田迪;孙伟;张万松;;一种改进的XML向量空间模型及其近似匹配算法[A];第二十三届中国数据库学术会议论文集(研究报告篇)[C];2006年
中国博士学位论文全文数据库 前7条
1 辜嘉;基于计算机视觉技术的心血管图像建模与分析[D];东南大学;2005年
2 王桐;XML内容路由关键技术研究[D];哈尔滨工程大学;2006年
3 丘宏俊;基于知识的飞机装配工艺设计关键技术研究[D];西北工业大学;2006年
4 张毅;群智能算法的改进及其在相关领域中的应用[D];吉林大学;2009年
5 黄鹏;基于广义半监督学习方法的软件质量预测研究[D];上海交通大学;2010年
6 肖冰;人脸画像—照片的合成与识别方法研究[D];西安电子科技大学;2010年
7 田亚明;铁路网编组站改编能力配置优化研究[D];北京交通大学;2012年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 李方洁;基于智能算法的DNA序列比对研究[D];山东师范大学;2011年
2 苏电波;群体智能算法研究及其在生物序列比对中的应用[D];江南大学;2011年
3 吴超;蛋白质功能预测的半监督学习算法研究[D];福建农林大学;2011年
4 杨洁;基于信息素强度的蚁群算法及其应用研究[D];湖南大学;2009年
5 许梁海;蚁群算法及其在案例检索中的应用研究[D];合肥工业大学;2006年
6 王芳芳;免疫遗传算法在生物序列比对中的应用[D];东北师范大学;2006年
7 陈娟;生物序列比对的并行计算以及启发式算法[D];扬州大学;2006年
8 宋春芳;基于缓冲的XML语义检索系统研究与设计[D];山东大学;2007年
9 李丽娟;XML文档结构相似度研究及在文档聚类中应用[D];山东大学;2007年
10 刘维;生物信息学中的并行处理[D];扬州大学;2007年
【二级参考文献】
中国期刊全文数据库 前3条
1 龚道雄,阮晓钢;一种基于遗传算法的DNA多序列比对方法[J];北京工业大学学报;2003年01期
2 沈世镒;多重序列比对Alignment的信息度量准则[J];工程数学学报;2002年04期
3 李军焘,刘来福;生物序列比对的数学模型及应用[J];数学的实践与认识;2005年01期
【相似文献】
中国期刊全文数据库 前10条
1 李伟群;;人手跟踪方法研究综述[J];计算机与数字工程;2010年09期
2 陈占龙;吴亮;刘焕焕;;基于图模型的多边形自动构建算法[J];微电子学与计算机;2011年08期
3 刘棠丽;吴心筱;梁玮;贾云得;;基于非参数信念传播的可行C-空间关节人手跟踪方法[J];计算机辅助设计与图形学学报;2008年04期
4 李伟群;邬家炜;;基于团结构的三维关节人手跟踪方法[J];计算机工程;2010年23期
5 王昊冉;白亮;老松杨;;基于图模型的足球视频语义建模方法[J];计算机科学;2011年06期
6 王汾;张玉峰;;用户导航历史的半结构时序图模型研究[J];现代图书情报技术;2006年02期
7 刘玮;陈新武;田金文;;目标语义概率模型在类目标识别和地物场景分析中的算法研究[J];计算机科学;2009年07期
8 应伟勤;李元香;徐星;王玲玲;;基于图模型的图像分割并行算法研究与实现[J];模式识别与人工智能;2007年04期
9 刘洪涛,程良伦;基于活动/资源/时间图模型的过程建模方法[J];现代计算机;2005年05期
10 孙敏,马蔼乃,薛勇;树模型的三维可视化研究[J];遥感学报;2002年03期
中国重要会议论文全文数据库 前10条
1 陆斌;骆志刚;苏光龙;丁凡;;RNA序列结构比对算法综述[A];中国电子学会第十六届信息论学术年会论文集[C];2009年
2 李文波;孙乐;黄瑞红;冯元勇;张大鲲;;基于Labeled-LDA模型的文本分类新算法[A];第三届全国信息检索与内容安全学术会议论文集[C];2007年
3 黄云平;孙乐;李文波;;基于上下文图模型文本表示的文本分类研究[A];第四届全国信息检索与内容安全学术会议论文集(上)[C];2008年
4 赵炫;王生进;丁晓青;;一种应用于特征点匹配的改进图模型算法[A];第十二届全国图象图形学学术会议论文集[C];2005年
5 徐俊杰;孙长嵩;张安真;;基于XML的三维场景数据的组织与表示模型[A];2006北京地区高校研究生学术交流会——通信与信息技术会议论文集(下)[C];2006年
6 李晓光;乔文;宋宝燕;于戈;任永功;;一种高效的基于图的MLCA求解方法[A];第二十五届中国数据库学术会议论文集(二)[C];2008年
7 丁礼儒;谈正;仝晓敏;;基于多视点视频的感知系统[A];第一届建立和谐人机环境联合学术会议(HHME2005)论文集[C];2005年
8 颜志军;;基于UML的多视图动态企业模型框架研究[A];全国第八届工业工程与企业信息化学术会议论文集[C];2004年
9 胡珀;;基于图模型的多文档自动文摘(英文)[A];计算机技术与应用进展·2007——全国第18届计算机技术与应用(CACIS)学术会议论文集[C];2007年
10 李晓光;宋宝燕;;GPE:一种基于图模型的NFS有意义结果确定模型[A];第26届中国数据库学术会议论文集(A辑)[C];2009年
中国重要报纸全文数据库 前2条
1 刘庆;Excel决策树之初体验[N];网络世界;2006年
2 徐坚;游戏中的场景制作(二)[N];中国电脑教育报;2003年
中国博士学位论文全文数据库 前10条
1 谢昭;图像理解的关键问题和方法研究[D];合肥工业大学;2007年
2 宋成芳;动态植物场景的建模与仿真研究[D];浙江大学;2007年
3 任柯燕;基于机器视觉的室外场景图像理解方法研究[D];北京邮电大学;2012年
4 李颖哲;基于线性图理论的可扩展单元复合仿真方法[D];上海交通大学;2008年
5 梁大为;视频运动对象跟踪技术研究[D];哈尔滨工业大学;2010年
6 王峻峰;分布环境下的协同装配序列规划[D];华中科技大学;2004年
7 黄健斌;基于条件概率图模型的Deep Web数据抽取与集成研究[D];西安电子科技大学;2007年
8 黎新;面向问答系统的段落检索技术研究[D];中国科学技术大学;2010年
9 俞俊;基于可视媒体融合的二维数字角色生成研究[D];浙江大学;2009年
10 冯国忠;文本分类中的贝叶斯特征选择[D];东北师范大学;2011年
中国硕士学位论文全文数据库 前10条
1 邹加棋;中文网页自动分类关键技术研究[D];福州大学;2006年
2 杨宏志;集成化公路CAD系统工程数据库的研究与开发[D];长安大学;2000年
3 朱岳;基于三维分枝模型的树木模拟算法研究及其实现[D];湖南大学;2005年
4 杨进;基于粒子滤波的多目标跟踪算法研究[D];上海交通大学;2009年
5 张绪青;基于图模型的聚类算法研究[D];浙江大学;2008年
6 高桂桂;基于分形的三维树模型研究及可视化系统研建[D];北京林业大学;2008年
7 胡晓辉;基于团结构的文本分类技术研究[D];江西师范大学;2008年
8 邹显春;基于活动图模型的工作流形式化语义研究[D];西南师范大学;2003年
9 张凯峰;基于KPI的企业运营管理信息系统研究与实践[D];中国科学院研究生院(软件研究所);2004年
10 熊蜀光;图模型XML数据上查询处理方法的研究[D];哈尔滨工业大学;2006年
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