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《中国西部动物学学术研讨会论文摘要汇编》2012年
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多头带绦虫成虫转录组研究

付彦  吴徐行  杨德英  聂华明  古小彬  王淑贤  杨光友  
【摘要】:背景多头带绦虫是一种全球性的绦虫,其幼虫阶段寄生在羊和其他家畜的中枢神经系统,通常导致死亡和巨大的社会经济损失,特别是发展中国家。该寄生虫也能导致人的感染,但是由于诊断技术和研究的缺乏而被忽略。第二代测序技术的最新发展为探索多头带绦虫的转录组提供了机会。方法/发现我们利用Illumina成对测序技术和新的Trinity组装软件得到了31,282个unigenes(平均长度920bp)。通过与公共数据库(Nr,UniprotKB/Swiss-Prot,COG,KEGG,UniProtKB/TrEMBL,InterPro,Pfam)的比对,转录分子得到了基于序列的注释和基于区域的注释。我们鉴定了26,110(83.47%)unigenes还推测出20,896(66.8%)CDS。同时,与其他绦虫(豆状带绦虫和莫尼茨绦虫)和与肠道寄生虫(旋毛虫,犬钩虫与猪蛔虫)的转录本比较分析显示他们之间分别存在着一些相同的酶或者同源的基因,成为支持寻找有潜力的药物靶点。再者,多头带绦虫与豆状带绦虫的比较转录组分析揭示了两物种之间基因表达,GO功能分类和生物代谢分配的相似点和不同。结论本研究为多头带绦虫成虫阶段转录组提供了详细全面的了解,证实了比较转录组探究值得作为进一步研究。该转录组数据为多头带绦虫的生物学基础知识的了解,帮助药物靶点的鉴定和寄生虫-宿主间关系的研究提供一个坚实的公共平台。
【作者单位】:四川农业大学动物医学院
【分类号】:S852.734

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