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Stochastic retrotranspositional activation of a rice endogenous retrotransposon Tos 17 by inter-strain hybridization

FRéDéRIC Ngezahayo  
【摘要】:正Plant mobile elements remain largely quiescent during normal growth and development, but can be activated by stress.In rice,the most active endogenous mobile element hitherto discovered is the copia-like LTR retrotransposon Tos17,which showed high frequency of retrotransposition under tissue culture conditions,and also in some wide hybrids.Here,we show that Tos17 can become retro- transpositionally active in certain inter-strain hybrid plants in an apparently stochastic manner.Interest- ingly,plants showing Tos17 retrotransposition were detected only in one cross direction of one of the three sets of reciprocal inter-strain rice hybrids studied.DNA methylation analysis showed that,in con- trast to previous situations of tissue culture and wide-hybridization,Tos17 retrotransposition in the in- ter-strain hybrids was not associated with element demethylation;instead,the plant showing the most active retrotransposition turned out to possess a higher level of CNG methylation than its parental line and sibling hybrid plants that did not show retrotransposition.Isolation of five de novo insertion sites indicates that the activated element copies have transposed into different chromosomal regions,with one copy being in a polyprotein-encoding sequence,one in a catalase gene,and the rest three in unknown se- quences.

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